包孝原籍浙江嘉兴人，后徙居松江华亭（今属上海）。其兄包节于嘉靖十一年（1532年）进士及第，过了三年，包孝也考中了进士。数年以后两人都当上了御史，而且他们都以刚直著名，只不过包节在北京，包孝在南京。包孝曾上疏世宗皇帝，揭发当时礼部尚书温仁和在任嘉靖二十年（1541年）会试的主考官时有舞弊行为，然而世宗并没有追究其事。

包孝及其哥哥包节之所以能成为刚正的御史，名垂史册，与其母亲的教育是分不开的。明末松江人周鼐记载了这样一件事：包节、包孝都还未中进士时，一天有客来访，与包孝在客厅中谈话。包孝母亲在里边问家人：“外边二郎在跟谁说话？”家人回答说：“是某甲。”“谈的是什么事？”“说是某处有一女子，人品很不错，但家中贫困，劝我们二少爷去买来作妾。”老夫人听了勃然大怒，立即吩咐家人把两个儿子叫进来，训斥说：“某甲这种人，是专门以花言巧语引诱年轻人的小人。你们不亲近贤人君子而亲近这种小人，不讨论文史道德而讨论买姬妾，我不能看着你们当败家子！”随即拂袖而去，不再理睬两个儿子，以后一个多月也不跟他们说话。于是包孝就每天早、晚两次跪在母亲床边承认错误，包节也哭着悔过，两人保证今后决不与某甲这种人来往，事情方才过去。