中华全国供销合作总社管理干部学院的前身是创办于1950年中华全国合作社联合总社干部学校，1954年更名为中华全国供销合作总社干部学校。1983年，总社干部学校、商业部干部学校、粮食部干部学校三校合并，成立北京商业管理干部学院。2010年经批准加挂中华全国供销合作总社国际交流促进中心。2020年11月经中编办批准，正式更名为中华全国供销合作总社管理干部学院。

建院70年来，学院始终坚持正确的政治方向，突出业务建设、科研建设，聚焦“三农”和供销合作事业发展需要，以专业化、系统化干部培训教育为己任，努力打造全系统理论与实务的教学基地和正规化的干部培训学院，切实发挥平台、窗口、智库的作用，为供销合作社改革发展提供有力人才支撑。