2014年2月，北京地铁6号线二期工程实现洞通。2月12日，北京地铁6号线西延工程调整规划，将苹果园南路站、苹果园站由高架站改为地下站，并增设金安桥站。4月，北京地铁6号线二期工程开始铺轨。5月3日，北运河东站封顶。8月20日，北京地铁6号线二期工程与一期工程贯通调试。9月1日，北京地铁6号线二期开始动车调试。9月20日，北京地铁6号线二期工程开始空载试运行。10月31日，北京市规划委员会公示《北京地铁6号线二期工程沿线车站站名方案》。12月28日，北京地铁6号线二期工程（草房站至潞城站，通运门站、北运河东站除外）开通试运营。

2018年9月9日，北京地铁6号线西延线全线变电所“电通”。9月20日，北京地铁6号线西延线开始空载试运行。12月30日，北京地铁6号线西延线（金安桥站至海淀五路居站，苹果园站除外）开通试运营。同日，北京地铁6号线二期北运河东站开通。

2019年6月，北京地铁6号线列车分设“强冷”车厢和“弱冷”车厢。

2020年4月，“首都智慧地铁”在北京地铁6号线亮相，车厢内有很多高清“眼睛”，通过感知摄像头将视频传输到后台的“天枢系统”进行整合分析、边缘计算，可以识别乘客是否佩戴口罩、是否招手呼救或者晕倒等。

2021年11月5日，中国铁道科学研究院集团有限公司发布北京地铁6号线南延工程环境影响评价第一次公示。12月31日，北京地铁6号线西延线苹果园站开通。

2022年8月30日，北京地铁6号线二期南延段工程开工建设。

2023年1月13日，北京地铁6号线二期南延段工程取得施工许可证，进入正式施工阶段。3月18日，北京地铁6号线二里沟站开通。3月28日，北京地铁6号线列车受电弓自主维修基地投入使用。7月22日，6号线苹果园站E出入口和西换乘厅启用。

2024年3月31日，北京地铁6号线南延潞城—东小营南区间右线盾构顺利始发。6月20日，北京地铁6号线南延工程东小营南站主体结构实现封顶。自7月中旬起，6号线双休日将视客流情况适时启用新编暑期列车运行图，6号线双休日最小列车间隔将由5分缩至4分，增加运力投放25%。8月，北京地铁6号线南延工程车站已经封顶，盾构隧道将在9月实现双向贯通。 8月底，7号线一期工程实现13座车站主体封顶。

2024年9月4日夜间，北京地铁公司应用城轨综合检测车在地铁6号线开展了针对区间线路、供电、土建等专业的综合检测工作，北京地铁公司于今年起首次尝试应用城轨综合检测车，实现对6号线多专业综合检测，通过自动化、智能化分析，重点优化缓解列车运行过程中的振动、晃动等情况，进一步提高地铁线路巡检效率，提升乘客出行体验。

北京地铁6号线呈东西走向，起于金安桥站，大致沿阜石路、苹果园南路、田村路、玲珑路、车公庄西路、车公庄大街、平安里西大街、地安门西大街、地安门东大街、北河沿大街、五四大街、东四西大街、朝阳门内大街、朝阳门外大街、朝阳北路、富河大街、滨榆西路、通盛北路、盐滩路、司空分署街、通盛南路、赵登禹大街、杨坨东街、运河东大街敷设，止于潞城站。

截至2014年11月5日，北京地铁6号线日均客流在60万人次。

北京地铁6号线采用长春轨道客车股份有限公司研制的DKZ47型列车（64组，车号：06 001-06 064），使用8节编组B型列车（“六动两拖”，6M+2T），采用不锈钢车体。与2010年制造的DKZ31、DKZ32、DKZ33（分别用于北京地铁15号线、北京地铁亦庄线、北京地铁9号线）相比，该车使用1500伏特接触网供电，可以保障列车的供电性能，与DKZ33不同，北京地铁6号线列车并未有安装“黑匣子”，但却拥有1时15分的超长时间供电。列车与DKZ33唯一的相同点是可以从刹车摩擦与缓冲摩擦吸取电能。列车最高运行时速每小时100千米，旅行时速为每小时50至60千米。列车全列定员1976人，比普通6辆编组列车多承载400人。列车外观黑色底色，腰部涂有黄线，车头黄色和黑色搭配，昵称为大黄蜂。

北京地铁6号线拥有车辆基地3座，五路停车场、五里桥车辆段和东小营车辆段。五路停车场位于慈寿寺站西北方向，与北京地铁10号线共用，列车停放在停车场地下一层。北京地铁6号线五里桥车辆段位于草房站和物资学院路站之间。北京地铁6号线东小营车辆段位于潞城站东南。

北京地铁6号线的室内设计理念为“京城连廊”，突出线路串联内城、CBD、金融街、东部居住区等大量城市区域的特色。

北京地铁6号线一期车站的装修采用“砖之韵、廊之韵”的设计构思，通过古城青砖、近代红砖、现代彩砖等墙面装饰变化来体现西城、旧城、CBD及重点发展区等不同区段的城市印象，各个车站均以不同颜色的砖进行装饰，同时又有各自的特色，营造出跨越北京历史与现代的地下时空回廊。海淀五路居站至车公庄西站段采用20世纪50年代至80年代建设的红砖建筑，车站内部也采用红色的砖饰面；车公庄站至朝阳门站段穿过老北京城，地上建筑采用灰砖房屋，车站内部也采用灰色的砖饰面；东大桥站至草房站段是1990年代后快速发展起来的新兴都市区，采用彩色的砖饰面。

北京地铁6号线一期设置多个装修重点站，其装修风格又各自不同。车公庄西站采用1950年代建设的苏联式建筑，车站内部采用大量拱顶设计，模仿莫斯科地铁的车站风格；北海北站临近皇家园林，采用绿琉璃色的重檐飞椽，体现皇家园林的气派；南锣鼓巷站临近四合院区，仿照四合院的建筑风格进行装饰；东四站采用接近原木颜色的梁柱装饰；朝阳门站结合车站结构，在站厅内布置倒“U”型的“门”，包含朝阳门历史上曾是漕运粮食进京的城门的寓意。

北京地铁6号线二期贯穿通州北运河两岸；通州北关站、通运门站、北运河西站使用中庭式设计，首次在北京地铁车站中引入中庭的空间形式，并进行消防性能化设计；物资学院路站、郝家府站、东夏园站、潞城站以大运河为主题，选用了四种不同的颜色作为主题，代表大运河所经过的四大流域。通运门站为国内首个轨行区敞开的Y形柱中庭式车站；北运河西站位于商业地块内，利用上方步行广场和绿地设置了天窗，为北京地铁首个设置天窗的地下站。

北京地铁6号线西延车站的装修延续北京地铁6号线“京城连廊”的设计理念，即连接“历史的北京、现在的北京、发展的北京”，在车站装修设计中充分考虑老北京青砖的应用与展开，并根据不同地段采用西部红砖、中部灰砖、东部彩色砖形成明确的分段节奏与色彩。田村站、廖公庄站、西黄村站、杨庄站四个标准站均采用西部工业感和生活印记的红砖墙面，并充分利用暗挖站高拱顶的结构特点，中跨吊顶进行挑高处理；两个特色站中，苹果园站以“树”作为设计的主题元素，通过线性枝干的穿插错落表现树枝的丰富层次，枝干从吊顶延续到墙面，塑造出树林的视觉效果；金安桥站临近首钢特色产业园区等创新产业基地，是一个由传统工业向创新产业过渡的重点节点，故车站装修方案采用虚与实的处理形式，通过设备裸露的时代工业感和现代造型气息的铝板，既营造出首钢的历史记忆，又体现出创新产业的未来。

北京地铁6号线二期南延段工程建设内容为一站一区间，线路全长约2公里，车站建筑面积约1.9万平方米，计划于2025年底建成通车。

北京地铁6号线是横贯北京城东西的第二条交通大动脉，作为地铁骨干线路，对缓解北京地铁1号线客流压力、缓解北京东西向地面交通压力起到了至关重要的作用。（新京报、北京晨报 评）

北京地铁6号线二期是通州副中心核心区的交通干线走廊，承担了通州副中心与北京CBD核心区无缝衔接的新功能，通州北关站和通运门站直接位于通州核心区高密度开发核心地区，车站与周边开发密切配合，可形成带动周边地区发展的交通骨干作用。是城市东西向的就业、居住交通走廊，是主城向东延伸的一条重要发展轴，与北京地铁1号线共同构成东西方向轨道交通干线，承担城市客流的主要客运任务。北京地铁6号线二期将通州区东部新城（现定位为城市副中心）、定福庄边缘集团及门头沟新城等与中心城区联系起来，带动沿线通州核心区、会展中心、东小营等东部地区的发展，对中心城区的人口和产业向外围转移起到了有力的支持。（北京市交通委员会 评）

北京地铁6号线南延工程作为北京中心城东西方骨干线6号线的延长线，是北京城市副中心轨道交通线网规划中的重要一环，对疏解非首都功能，对提升副中心行政办公区、生活服务区的轨道交通服务水平和提升绿色出行品质，完善城市副中心交通配套功能具有重要意义。