北京大学干细胞研究中心毗邻北京大学第三教学医院。所处的地点还汇集了众多大学研究机构包括人类疾病基因组中心，为基础医学到临床研究提供了优良环境。北京市政府的支持和北医基因科技公司的鼎力相助，加快了创新技术的商业化进程。

中心目标是建立不同组织和器官的成体干细胞库，我们研究的重点是，通过对ES细胞和不同组织干细胞基因以及蛋白表达谱的比较，来阐述胚胎干细胞分化成不同组织干细胞的调控机理；以及通过细胞移植治疗细胞退行性变疾病，如糖尿病、帕金森病等。我们已经开展了神经干细胞、胰岛干细胞和其他成体干细胞的研究。我们成功修复了兔的受损角膜，对角膜疾病的治疗正在进行临床试验。

本中心有40名全职的科研人员，他们当中包括博士和博士后学生。另外，本中心还有多为客座教授，他们都是世界上干细胞研究领域中很有名望的科学家。中心在2000-2002年的研究经费预算大约是400万美元。