2001年，学校与日本东京都淑德巢鸭高中建立友好校关系，体育馆、图书馆落成，风雨操场建成。

2002年，经北京市教委专家组验收，认定北京九中为北京市示范性普通高中。

2004年，北京市授予九中招收外籍留学生资格。

2007年，学校与新加坡莱佛士书院建立友好校关系。

2009年，学校与美国巴尔的摩市PARK学校建立友好学校关系。将北方工业大学附属中学建立为九中初中部，并创办九中教育集团。

2010年2月，学校恢复初中部，成为完全中学。

2011年，学校与瑞典乌普萨拉市ROSENDALS高中建立友好学校关系。

据2017年4月学校官网显示，学校建有数学实验室、生物数码实验室、气垫导轨传感实验室、化学分析实验室、机器人实验室、模拟驾驶实验室。同时拥有1栋教学楼、1栋学生宿舍楼和1栋教师住宅楼和1个重点实验室。有400米跑道的操场和1个25米长的游泳池。

据2017年2月学校官网显示，学校占地面积150亩，有高中教学班40个、学生1500余名，初中教学班30个、学生1100余名。

截至2015年3月，学校共有专任教师125人，校级特级教师2人，市、区学科带头人、骨干教师31人。博士、硕士达60人。

北京市学科带头人：武凤鸣

北京市骨干教师：林乐光、刘永江、唐翠萍、王世宏、赵文彦

石景山区骨干教师：陈玖琳、陈学义、杜江、杜巍、高笑旭、韩维祥、何英茹、隽军宁、张国雁、刘凤宏、李学、刘磊、李杰、李宏爽、潘瑞霞、潘晶晶、任秀丽、夏启文、王永森、严红艳、游宏、张妍、张小萌、张晶晶、郑冬梅

校级特级教师：邢军、肖伟华

2015年4月12日，在北京市中学生数学竞赛中，学校9名学生获得一等奖，10名学生获得二等奖。

2016年10月22日，在第三十四届石景山区学生科技节中，学校3名学生获得一等奖；3位获得二等奖；7位学生获得三等奖。

2016年10月23日，在参加北京电视台主办的青少年科技创新大赛中，北京九中两名学生获得机器人探险与排障比赛亚军。

2016年11月7日，在北京九中高一年级“博学杯”知识竞赛中，高一（3）班团队夺得了冠军，高一（1）班和高一（2）班均获得优胜奖。

2017年3月14日，在“博学杯”校园辩论赛中，学校6名学生获得优秀辩手。

2017年3月27日，在“登峰杯”全国中学生学术科技创新大赛中，学校2名学生的论文在学术作品竞赛中获得了二等奖。4位学生组建的团队在数学建模竞赛中，获得了二等奖。4位学生组建的团队获得了数学建模竞赛优秀奖。3位学生组建的团队，在结构设计竞赛中获得了三等奖。

2013年10月22日，在第六届北京可持续发展教育国际论坛中，学校有8位教师获得一等奖，3位教师获二等奖，3位教师获三等奖。

2015年7月9日，在第七届“舞林大会”中，2名教师获得标准组华尔兹一等奖和探戈一等奖，2名教师获得标准组探戈二等奖。

2016年7月，学校教师在“飞扬的旋律”京津沪渝钢琴大赛中，获得钢琴大赛金奖。

2016年9月12日，在第二届“寻找身边最美教师”颁奖活动中，学校16名教师获得“最美教师”。

2016年10月，在“第六届全国农村及少数民族地区中小学英语课堂教学与教师发展研讨会”中，学校2名教师获得一等奖。

1990年，学校被评为北京市青少年科技活动先进单位。

1992年，学校被评为北京市爱国卫生先进单位。

1994年，学校被评为首都绿化美化花园式单位。

1998年，学校被评为北京市实验教学普及工作先进单位。

2003年5月，学校被认定为“北京市示范性普通高中”。

2005年，学校被评为北京市文明礼仪示范学校。

2012年，学校被国家体育总局和教育部认定九中为国家级体育传统项目学校。

2016年，学校被授予“北京市科研先进学校”。

2020年5月，入选北京市中小学科技教育示范学校名单。

2022年4月，北京市第九中学2020级10班团支部荣获“北京市五四红旗团支部”称号。

2023年6月，入选首批全国健康学校建设单位名单。

释义：标志以中国传统文化中表达融合、均衡的太极图隐于形似逗号的“9”字中间，寓示北京九中是一个充分整合资源、形成和谐整体的不断进取的优质学校。逗号意味着北京九中治学无止境，锲而不舍的境界。

砺身砺志 博爱博学

释义：身须磨砺——砺身方有体形、体态之健美，体质、体格之强壮；志须砥砺——砺志方能开发潜质、追求卓越,并塑造人格，完善品德；爱应广博——博爱是人生的大悲悯、大关怀，仁爱无限,唯有宽容平和，海纳百川，学应渊博——博学是智慧的高目标、高境界，治学无限,唯有孜孜以求，锲而不舍。

截至2013年1月，北京市第九中学设立了10余个学生社团组织。