1872年，学校前身“慕贞书院”创建，后称“北京慕贞女子中学”，是中国最早的教会女子中学之一。与汇文、育英、贝满并称京城“四大教会名校”。

1952年，更名为“北京女子第十三中学”。

1972年，更名为“北京市第一二五中学”。

2016年，学校加入北京汇文中学教育集团，并更名为“北京汇文实验中学”。