1879年实施郡区町村编制法，南半部原属大阪三乡的区域成立为直接隶属大阪府的北区；1889年北区与原本同样隶属大阪府的东区、西区、南区改隶属新设立的大阪市。同时由于实施町村制，如今的北区北半部区域则属于西成郡曾根崎村、北野村、川崎村、丰崎村、鹭洲村、中津村共六个行政区划；前三个村在1897年被并入大阪市，当时连同同时间被并入大阪市的上福岛村、下福岛村、野田村都被划入北区。不过在1925年，原属于上福岛村、下福岛村、野田村的区域被划出新设立为港区和此花区；同时丰崎町、鹭洲町、中津町也被并入大阪市，最初是划入东淀川区和西淀川区，在1943年这三个行政区划位于淀川南岸的区域改划入新设立的大淀区。1989年，大阪市再度调整行政区划，将原本的北区与大淀区合并为如今的北区。