1988年建立医学图书情报学系（正处级单位），实行图书馆、医学图书情报学系、医学情报研究所合一的管理体制。

1994年，图书情报学系更名为医学信息学系，设有信息管理、信息检索与利用、信息技术、信息分析等4个教研室。

1993年——成立卫生管理系

1993年成立卫生管理系，实行“中心”和系合一的管理体制。卫生管理系为公共卫生学院当时的四个系之一。设有卫生政策与管理、卫生经济、医院管理、卫生法学、组织行为学、卫生管理基础等6个教研室。

1995年获“社会医学与卫生事业管理”硕士学位授予权。1996年正式招收该专业硕士研究生。

2001年——成立医药卫生管理学院

2001年，华中科技大学根据学科建设与发展的需要，将卫生管理系、医学信息学系、卫生部卫生管理干部培训中心合并，成立了医药卫生管理学院。设有卫生管理系、医学信息系、药品监督与管理系。

2003年获“社会医学与卫生事业管理”博士授予权和“情报学”硕士授予权，2004年正式对外招生。

2005年8月，学院根据学科发展的需要进行机构调整，设置五个系，即医院管理与医事法学系、卫生政策与经济管理系、药品政策与管理系、综合素质与卫生人力管理系和医药信息管理系。

2006年5月，《医学与社会》杂志归并医药卫生管理学院。

学院设有卫生管理系和医药信息管理系，有中国基本医疗保障、农村卫生发展、医院管理与发展、药物政策与管理、健康信息资源、高等医学教育等6个研究中心；有卫生部卫生管理干部培训中心、卫生信息管理中心实验室，以及1个专业图书资料室和1本专业杂志《医学与社会》（中国科技核心期刊）。

学院是本学科国内重要的教育机构。现有公共事业管理（3个专业方向：卫生事业管理、药品监督与管理、医事法学）和信息管理与信息系统（医学）2 个本科专业；有社会医学与卫生事业管理、医院管理、卫生信息管理、情报学4个研究生学科专业；有社会医学与卫生事业管理博士后流动站，有省级实验示范中心一个。学院还先后在深圳、重庆、天津、湖北等地建立了多家教学、科研基地。现有普通本科生、研究生、留学生424人。几十年来学院始终以培养具有良好素质，能适应我国卫生事业发展的复合型、高素质人才为目标，注重学生综合能力的培养。2010年公共管理专业成为湖北省品牌专业，社会医学与卫生事业管理学科在全国名列前茅，《中国大学评价》连续5年将我校该学科评为A++，排名第二。毕业生受到社会广泛赞誉，大多数毕业生已成为卫生部、卫生厅（局）及大型医院的领导者和骨干。

学院是国内卫生管理领域重要的研究机构，是国家卫生信息化标准研究基地之一。主要研究方向包括农村卫生政策与管理、基本医疗保障、医院及护理管理、社区卫生服务、健康信息资源管理多个领域。先后承担了国家自然（社会）科学基金项目36项（其中重点项目1项）、国家“十五”科技攻关项目1项、教育部、卫生部等各部委及省市科技计划课题287余项，国际合作项目21项。2004年以来获省（市）科技进步奖26项，中华医学奖3项，省社会科学优秀成果奖1项，发表学术论文2000余篇，其中SCI（SSCI）收录文献45篇；出版专著15部，主编（副主编）各类教材52部。学院在卫生管理领域的众多科研成果为各级政府决策所采纳，为国家医疗卫生改革提供了依据，形成了较强的社会影响力。

学院是国内最大的卫生管理培训机构和主要的咨询机构。1982年以来，依托卫生部卫生管理干部培训中心培训了9300多名卫生行政部门、医院、CDC、妇幼保健等医疗卫生机构的管理者。在国家医疗卫生体制改革中，参与了“医改”系列决策的咨询工作，以及世界银行等多个主要项目的咨询。

随着中国医药卫生体制改革的不断深化，医药卫生事业将面临前所未有的机遇和挑战。学院将秉承 “进德修业、自强不息”的院风和“质量、特色立院”的建院方针，瞄准国内、国际先进水平，努力打造一个崭新平台。建设中国最好、最富有特色的医药卫生管理学院，使其成为国家卫生部等部委决策咨询的重要机构之一，成为湖北并辐射邻省的卫生管理研究、咨询和人才培养中心。