十二原的内容有两种说法：一为《灵枢·九针十二原》所述：五脏各有原穴左右各一，加之膏、肓原穴各一，合为十二原。肺原太渊，心原大陵，肝原太冲，脾原太白，肾原太溪，膏原鸠尾，肓原脖胦。二为《灵枢·本输》、《难经》及《针灸甲乙经》所述：十二经皆有原穴，故称十二原。即除上述五脏原穴外，大肠原合谷，胃原冲阳，小肠原腕骨，膀胱原京骨，三焦原阳池，胆原丘墟，心包原大陵（心原神门）。历代从后说将十二原视为十二经之原穴。同时，心肝脾肺肾五阴经之原穴，又称“五输穴”，张介宾《类经图翼》解释为“阴经之输并于原”，即阴经“以输为原”的原因。而阳经六腑除各经输穴外，另有原穴。