1960年4月，中央华侨事务委员会在《创办华侨大学方案（草案）》中就提出创办政治系的计划，1962年正式成立政治系，当年秋开始招生。政治系下设中共党史、政治经济学、马克思主义哲学、国际共产主义运动史4个教研组和一个报刊资料室。至1965年教职工有60多人。政治系除担负政治学本科专业教学外，还承担全校公共政治理论课的教学任务。“文革”期间，学校各项事业遭到破坏。1978年学校复办后，政治系没有随之恢复，但学校设立马列主义教研室，任务就是承担全校公共政治理论课的教学。1984年10月，学校决定将马列主义教研室改为社会科学基础教研室，仍为学校的直属教研室。1986年1月，社会科学基础教研室升格为社会科学基础部。1992年9月，学校批准社会科学基础部改为社会科学系。1996年，学校批准社会科学系改为国际经济系，同时保留社会科学基础部建制（合署办公）。2000年6月，学校决定设立经济管理学院，国际经济系并入经济管理学院。2001年6月，学校成立人文社会科学系（独立建制），同时将华侨华人研究所作为人文社会科学系的挂靠单位。2004年10月，学校决定将人文社会科学系升格为人文与公共管理学院。2009年9月，学校为统筹兼顾泉州、厦门两个校区的学科建设，充分发挥侨校的特色和优势，决定将人文与公共管理学院拆分为公共管理学院、哲学与社会发展学院、华侨华人研究院和思想政治理论课教研部，其中思想政治理论课教研部与公共管理学院合署办公。2012年7月，学校为贯彻落实中央关于加强和改进思想政治理论课教学的有关精神，进一步推进马克思主义学科建设，探索具有侨校特色的通识教育体系，决定在思想政治理论课教研部的基础上成立马克思主义学院/通识教育学院，作为承担从泉州校区到厦门校区，从国内生到外招生，从博士生到硕士生到本专科生这样全方位、多层次、多类型学生的思想政治理论课和通识教育课的专职教学科研部门。