更新时间：2022-12-18 16:14
1959年，《南京中医学院学报》创刊。
1982年，该刊被中国知网收录，以季刊形式发行。
1994年，该刊由季刊改为双月刊发行。
1995年，该刊更名为《南京中医药大学学报》。
2014年12月，该刊入选中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。
2021年12月15日，《南京中医药大学学报》第九届编委会第一次会议在行政楼316会议室召开。
2022年，该刊变更刊期，由双月刊改为月刊，每月10日出版。
《南京中医药大学学报》设有名老中医学术传承、论著（学术探讨、临床研究、实验研究）、报道等专栏。
《南京中医药大学学报》刊登中医、中药、针灸、中西医结合等方面的学术论文及有关情报资料。
据2022年12月《南京中医药大学学报》编辑部官网显示，《南京中医药大学学报》第九届编委会有编委96人、青年编委会26人。
据2022年12月17日中国知网显示，《南京中医药大学学报》共出版文献量为7186篇。
据2022年12月17日万方数据知识服务平台显示，《南京中医药大学学报》共出版文献量为4295篇、基金论文量为2670篇。
《南京中医药大学学报》是中国科技论文统计源刊（中国科技核心期刊）、中国核心学术期刊、北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊（2008年版、2011年版、2014年版、2017年版、2020年版）、CSCD中国科学引文数据库来源期刊（2021-2022年度）、WJCI科技期刊世界影响力指数报告（2021）来源期刊，被CA化学文摘（美）（2022）、JST日本科学技术振兴机构数据库（日）（2022）等收录。
据2022年12月17日中国知网显示，《南京中医药大学学报》总被下载次数为1822476次、总被引次数为71813次；（2022版）复合影响因子为2.604、（2022版）综合影响因子为1.81。
据2022年12月17日万方数据知识服务平台显示，《南京中医药大学学报》被引量为55961次、下载量为317191次；据2020年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为2.45，在全部统计源期刊（6292种）中排第449名。
《南京中医药大学学报》曾被评为《CAJ-CD规范》获奖期刊、中国高校优秀科技期刊、华东地区优秀期刊、江苏省优秀期刊、中国高校百佳科技期刊。
1、论文具有先进性、科学性、逻辑性，要求主题明确、结构严密，层次分明，文字精练、图表简明。文章一般不超过6000字（不包括图表和参考文献）。
2、该刊已开通网上投稿，请注明稿号及第一作者姓名。该刊不接受纸质投稿或邮箱投稿，基金项目和专利需提供相关证明复印件。
3、作者在投稿时，请自留底稿。作者在接到收稿回执后3个月未收到稿件处理意见，可联系该刊退稿，不得私自一稿多投。该刊对稿件有修改权，凡有涉及原意的修改将征得作者同意。修改稿逾2个月不寄回者，视为自动撤稿。
4、稿件确定刊用后，根据所占版面与插图数量收取版面费，彩图需付彩图印制工本费。
5、该刊优先发表下列文章：①属于中国国家重点研究项目的文章；②受到省部级以上基金资助的文章；③有重要指导性意义或发表后具有广泛引用价值的文章；④有重大发现，发表后准备报奖的文章。