2003年5月19日被国家劳动和社会保障部批准晋升“南京市交通高级技工学校”，同年6月2日省政府授权江苏省劳动和社会保障厅批准增挂“南京交通技师学院”校牌；2004年4月被教育部等六部门列为“汽车运用与维修专业紧缺型高技能人才培养培训基地”，2006年被教育部授予“国家级职业教育（汽车运用与维修专业）实训基地”，获“江苏省职业教育先进集体”、“江苏省第二批高技能人才培养示范基地”荣誉、资质，具有南京市高技能人才培训基地、南京市专业技术人员继续教育基地、南京市劳动预备制培训基地、省级技能鉴定所等资质，并与重庆交通学院、金陵科技学院等联合办学，进行大专、本科学历教育。

学院围绕精准的人才培养目标，构建有梯度的课程体系，打造企业级的实践平台，努力培育优秀的领军型高技术技能人才。学院在校生规模达 6000 人，年招生稳定在 1800 人以上，办学层次为初中起点技工类和中专类，并与高职院校对接开展“ 3+3 中高职分段培养”。学院与华为、比亚迪、特斯拉、舍弗勒、五十五所等众多名企建立深度校企共培合作关系，毕业生就业率常年保持在 95% 以上，生岗比达 1:3 ，校企合作企业满意率、毕业生和家长满意率皆保持在 98% 以上。学院技能大赛成果丰硕，学生先后荣获技能大赛国家级金牌 18 枚、省级金牌 30 余枚， 300 余人在各级各类技能大赛中获奖， 20 余名学生通过直接录取进入本科院校深造。建校 40 余年来，累计为社会培养输送了 5 万余名高素质技术技能人才。