2020年5月10日，“2020中国品牌500强”排行榜发布，南京医药排名第227位。

2020年7月27日，南京医药位列2020年《财富》中国500强排行榜第267位。

2021年7月12日，入选商务部等8单位公布的第一批全国供应链创新与应用示范企业名单。

2021年7月，2021年《财富》中国500强排行榜发布，南京医药股份有限公司排名第273位。

许可经营项目：化学原料药，化学药制剂，抗生素原料药，抗生素制剂，生化药品，生物制品，中成药，Ⅱ、Ⅲ类医疗器械（植入类产品、体外诊断试剂及塑形角膜接触镜除外），精神药品（限二类），医疗用毒性药品销售（按许可证经营范围经营）。预包装食品，散装食品；保健食品销售。普通货物运输。一般经营项目：百货；五金交电；劳保用品；汽车配件；装饰材料；室内装饰服务。房屋出租；兴办各类企业项目投资开发。经营进出口业务（国家限定企业经营或禁止进出口的商品和技术除外）；信息咨询服务。

公司的主要发起人南京医药(集团)公司(原南京市医药公司)，始建于1951年，是经南京市人民政府秘办(51)第674号批复及华东军政委员会卫生部卫药字第555号批示成立，性质为公营企业，又名南京市公营医药公司，行政隶属于南京市卫生局。

1952年更名为南京市国营医药公司。

1995年，省、市医药公司分家，成立中国医药公司南京支公司。

1958年，与药材公司合并，称“南京市医药公司”。

1981年，集团公司同时使用“江苏省南京医药供应采购站”和“南京市医药公司”名称。

1988年，集团公司成为江苏省医药商业行业首家利税超千万元企业。

1993年，集团公司利税和销售收入居江苏省医药商业系统第一名，经南京市资信评级委员会评定，集团公司的资信级位为AAA级，同年被南京市体改委批准为股份制试点企业。

1994年，集团公司以其主要的经营性资产与原中国人民建设银行江苏省信托投资公司、南京市国有资产经营公司、南京天宇医疗器械总公司共同作为发起人，采用定向募集方式成立本公司。同年，本公司实现利润2047.37万元，较上年递增77.06%，居江苏省医药同类型企业的首位，国家医药局系统同类型企业综合效益第四位。

1994年10月，本公司出资295万元收购了南京溧水县制药厂(现更名为南京恒生制药厂)，1995年开始对其进行技术改造。

1995年底试生产，1996年形成生产规模。

2023年7月，南京医药(600713.SH)：发行可转债事项获得控股股东批复。

2024年1月，南京医药(600713.SH)发行可转债申请获得上交所受理。8月9日消息，据公开信息显示，南京医药股份有限公司发生工商变更，公司注册资本由131023.101200万元变为130932.604000万元。10月16日，南京医药发行可转债申请获上交所审议通过。

公司于2002年根据国内国际环境，提出“调整转型、创新再造”的思路目标，在“一体两翼”的基础上，逐步由传统医药商业企业向为公众和社会提供健康产品与服务的现代医药健康服务企业转型。公司从2002年开始推行药房托管，这在当时被视为是医药分开的一种模式和大胆的尝试。2008年，公司又提出“药房托管”向“药事服务”转变的理念，为客户提供标准化、专业化、个性化与增值化的药品解决方案和民众健康解决方案，用自己的行动实践“防腐、惠民、增效”的要求，得到了中央、军委及省市各级领导的肯定，也为越来越多的政府部门、专家、相关利益团体、医疗患者所认同，并为公司创造了显著的增量效益。公司全流域采用药事服务合作的医院有167家，包括三级医疗机构13家；药事服务业务已从沿海发展到边疆，从城市发展到乡镇，从地方医院托管到部队医院托管。

战略定位

在“一体两翼”[1]的基础上，以药品物流一体化及其增值业务为核心，构建基于订单为导向、以药事管理服务为特征的集成化供应链，为公众和社会提供健康利益管理与服务。

[1]一体两翼：以药品物流一体化及其增值服务核心业务为“主体”、以医药工业、（管理、产品）技术创新为“两翼”。

南京医药重视技术进步和自有产品的体系建设。公司是江苏省企业技术中心，控股的南京同仁堂药业有限责任公司为市级技术中心，获得市级技术进步三等奖，主要产品“排石颗粒”、“乳宁颗粒”为省市名牌产品，其质量和技术含量在国内同行业处于领先地位，品牌知名度高。公司旗下的“乐家老铺”商标2008年被评为江苏省著名商标。另一家控股子公司南京生命能科技开发有限公司主要产品厄多司坦、注射用鲨鱼肝刺激物质、蔗糖铁原料药及注射液、复方@—酮酸原料药及片剂也获得多项发明专利，并被列入国家和省重点扶持项目。2008年，公司按照国际先进标准，成立了药品质量检测技术服务中心，对所经营的药品开展质量检测，并正在申请成为具备正式认证资质的第三方检测机构，开展对外检测服务。公司获国家人事部批准设立“企业博士后工作站”；是ASHP美国医院药剂师中国会员以及中国医药设备工程协会的发起单位。公司还拥有包括国家认证的1482名药师、336名执业药师在内的大批专业技术人才队伍。

南京医药不仅在企业经营效益上取得了显著的成绩，而且更注重对企业治理结构和内涵式发展的管理要求。在2007年中国投资者管理年会上，公司获得“2006年度中国最佳投资者关系管理百强”上市企业称号和“2007年中国最佳投资者关系管理进步最快奖”的单项奖。作为与公众的健康生命息息相关的医药企业，公司始终把质量安全管理放在一切经营管理工作的首要位置，作为重中之重的工作，持续不懈地做好落实。企业以国家级信息化项目“药品质量安全追踪溯源管理系统”为依托，综合应用计算机、监控跟踪、互联网技术等高科技手段，对所提供的健康产品的流通全过程的各方面质量因素进行跟踪、控制、查询和信息共享，提升企业的供应链执行效率、药品质量安全监管水平、企业信息化水平和企业竞争力，实现药品质量安全监管和确保公众用药安全，共建共享和谐企业，推动企业的经济效益、环境效益与社会效益相统一，实现企业可持续协调发展，促进利益相关者共同发展，达到共赢。

集团公司已成为我国医药商业大型骨干企业，经营药品、医疗器械、化学试剂和玻璃仪器四大类商品两万多个品种，与全国400多个医药站及港、澳、日、美、欧洲客商保持着良好的购销关系。集团公司自成立以来具有连续42年盈利业务绩，是我国华东地区重要的医药采购供应中心。

公司1994年4月投资100万元购置专用设备建立实验室，组建了专门从事新产品研究开发的高科技企业--南京生命能科技开发公司，使之成为本公司的科研基地。本公司自成立以来，按现代企业制度的要求，构建企业经营模式，使本公司从商业企业初步发展成科、工、贸一体的企业集团。

成立海西营运中心

南京医药股份有限公司来了，这家国内医药流通业中首家上市公司，准备在厦门湖里区投资建设成立南京医药海西营运中心，继续开拓其福建市场的版图。

有业内人士分析，南京医药入驻厦门，或将引发福建药业市场新一轮并购潮。

南京医药的厦门据点由厂房改造而成。

股民起诉案开庭 牵出子公司股权腾挪悬疑

2014年10月13日，股民对南京医药的集体诉讼案在南京中院开庭。2014年3月，江苏省证监局对南京医药未及时披露信息进行了处罚，股民由此对南京医药提起诉讼，要求南京医药赔偿因未及时披露信息带来的损失。

南京医药隐瞒交易，将子公司卖出后又溢价买入，背离正常商业逻辑。

这三项信息为：放弃南京医药盐都有限公司优先增资权事项、放弃南京医药国际健康产业有限公司优先增资权事项和委托南药国际收购盐城恒健药业有限公司86.825%股权事项。

在双方庭辩过程中，股民受损日截止日期成为争论焦点。王智斌介绍说，上述三项重大交易都发生在2011年，南京医药认为后两项交易公司 于2012年3月7日补充公告，第一项交易公告时间应当是2014年3月20日。这意味着只要在2014年3月20日之前持有南京医药的股民，就有权利进 行索赔。

2011年10月17日，南京医药董事会通过决议，放弃对全资子公司盐都医药的优先增资权。10月18日，南京医药与陕西和合医药系统投资管理有限公司签订协议，陕西和合向盐都医药增资1.16亿元，其中6590万元是注册资金，5010万元为资本公积金。增资后，陕西和合 持有盐都医药86.825%的股权，南京医药持有13.175%。同时，盐都医药名称变更为盐城恒健，法定代表人变更为孙卫增，上述变更事项于2011年 10月21日办理了工商变更登记手续。

2022年4月，南京医药股份有限公司第一药店特药组被授予“南京市工人先锋号”。

2022年7月，位列2022年《财富》中国500强排行榜第281位。

2023年7月，入选2023年《财富》中国上市公司500强排行榜，排名第257位。

2023年7月25日，入选2023年《财富》中国500强排行榜，排名第300位。

2024年7月，位列2024年《财富》中国500强排行榜第318位。