更新时间：2022-03-30 14:05
1979年，《南京工业大学学报（自然科学版）》正式创刊，曾用刊名《南京化工大学学报（自然科学版）》、《南京化工大学学报》、《南京化工学院学报》。
1980年，该刊刊期确定为半年刊。
1986年，该刊刊期由半年刊变更为季刊。
1999年，该刊刊期由季刊变更为双月刊。
2014年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。
2017年3月23日，《南京工业大学学报（自然科学版）》正式启用微信公众号。
《南京工业大学学报（自然科学版）》主要刊登化学工程、材料科学与工程、机械与动力工程、生物与制药工程、土木工程、安全工程、信息自动化、基础学科等专业学科为主的最新研究成果。
据2019年3月《南京工业大学学报（自然科学版）》官网显示，《南京工业大学学报（自然科学版）》编辑委员会共有委员38人、常务委员7人、国际编委3人。
据2019年3月14日中国知网显示，《南京工业大学学报（自然科学版）》出版文献共4250篇。
据2019年3月14日万方数据知识服务平台显示，《南京工业大学学报（自然科学版）》载文量为2549篇、基金论文量为1541篇。
据2019年3月14日中国知网显示，《南京工业大学学报（自然科学版）》总被下载654155次、总被引25818次，（2018版）复合影响因子为0.489、（2018版）综合影响因子为0.350。
据2019年3月14日万方数据知识服务平台显示，《南京工业大学学报（自然科学版）》被引量为16518、下载量为113172；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《南京工业大学学报（自然科学版）》影响因子为0.31，在全部统计源期刊（6735种）中排第4209名。
《南京工业大学学报（自然科学版）》是中国科技核心期刊是北京大学《中文核心期刊要目总览（2008年版、2011年版、2014年版、2017年版）》来源期刊、中国学术期刊综合评价数据库来源期刊，被CA化学文摘（美）（2014）、美国《CSA》、波兰《IC》、Pж（AJ）文摘杂志（俄）（2014）、中国期刊网、《中国学术期刊（光盘版）》、中国化学化工文摘、中国生物学文摘、中国无机分析化学文摘、中国知网、万方数据资源系统数字化期刊、维普资讯网、中国科技论文在线、台湾华艺思博网全文收录。
2009年，该刊获中国科技论文在线优秀期刊奖、该刊编辑部获得全国高校科技期刊优秀编辑质量奖。
2010年，该刊获得第三届中国高校优秀科技期刊奖。
2011年，该刊编辑部获得中国高校科技期刊优秀团队奖、该刊官方网站获得中国高校科技期刊研究会优秀网站奖。
2015年，该刊获得中国科技论文在线优秀期刊一等奖、中国科技论文在线科技期刊优秀组织单位奖。
《南京工业大学学报（自然科学版）》曾获中国期刊方阵双效期刊奖、江苏省期刊方针双效期刊奖、第六届江苏省优秀期刊奖、全国高校自然科学优秀学报一等奖、江苏省十佳期刊奖、《CAJ-CD规范》执行优秀期刊奖。
办刊宗旨
执行中国共产党的科技兴国政策，贯彻党的百花齐放、百家争鸣的方针，浓厚南京工业大学的学术氛围，加强南京工业大学的学术创新，及时反映南京工业大学学科建设、科技创新的新成果，促进科技创新成果向生产力转化，提高南京工业大学的社会知名度，为促进中国工业发展做贡献。