医院现设有内科、外科、妇科、儿科、五官科、口腔科、中医科、康复科、麻醉科、疼痛专科等临床科室，2009年与市中医院合作开设了肛肠专科；医技科室设有药剂科、检验科、放射科、功能科（B超室、内窥镜室、心电图室）、手术室、消毒供应室及体检中心等；行政管理科室设有医院办公室、医教科、护理部、财务科、设备科、总务科、南湖综合办公室等。