1986年6月，改称空军政治学院。

1992年9月，整编为空军指挥学院分院。

1993年6月，恢复为空军政治学院。

1999年5月，空军政治学院转隶并入南京政治学院，改称南京政治学院上海分院。

2003年12月24日，全军第一个军队政治工作学博士后科研流动站和第一个政治学博士后科研流动站在该校挂牌成立。

2012年8月，该校设立首个武警边防部队教学实践基地。

2017年8月，南京政治学院并入国防大学政治学院。

截至2015年5月，学院拥有教授、副教授197名，博士研究生导师50名，硕士研究生导师142名，先后有5人入选国家“万人计划”和军队高层次科技创新人才工程，4人次获得军队杰出专业技术人才奖，47名专家教授享受政府特殊津贴，34人次被评为全国优秀科技工作者及全国全军优秀教师，179名教员获得“军队院校育才奖”金奖和银奖，170名教员享受军队优秀专业技术人才岗位津贴，形成了以教授副教授任学科带头人，中青年教员为教学科研骨干，老中青相结合的专业人才梯队。

截至2015年5月，学院拥有军队政治理论教育一系、军队政治理论教育二系、军事新闻传播系、马克思主义理论系、军队政治工作系、军事思想与军事历史系等教学院系，开办政治学、马克思主义理论、军事历史、新闻学、军队政治工作等5个本科专业。

学院是全军最早开始培养全日制本科生和研究生的院校之一，学院瞄准“国家一流、军队特色、南政品牌”的目标加强学科专业建设，已形成了横跨八大学科门类，任职教育、本科教育、研究生教育相互衔接和支撑，重点学科、特色学科、新兴学科协调发展的学科体系。

截至2015年5月，学院拥有马克思主义哲学、伦理学、政治经济学、军事法学、政治学理论、中共党史、国际政治、马克思主义理论、基础心理学、军事思想及军事历史、军队指挥学、军队政治工作学、图书情报与档案管理、应用心理、新闻与传播、军事学等16个硕士研究生专业；以及马克思主义哲学、马克思主义理论、军队政治工作学、新闻学、军事思想及军事历史、图书情报与档案管理等6个博士研究生专业和军队政治工作学博士后科研流动站、政治学博士后科研流动站等2个博士后科研流动站。

该院的马克思主义基本原理和军队政治工作学2个学科是国家重点学科；马克思主义理论、军队政治工作学、军事心理学等3个学科被总部列入军队“2110工程”重点建设学科专业领域；马克思主义哲学、马克思主义理论、新闻传播学、图书情报与档案管理、军事思想及军事历史等5个一级学科被确定为江苏省重点（培育）学科。

学院着眼中国特色军事变革对政工人才的要求，从以学历教育为主向以任职教育为主转变、以培养理论研究型人才为主向以培养实践应用型人才为主转变，形成了横跨八大学科门类，任职教育、研究生教育、本科教育相互衔接和支撑，重点学科、特色学科、新兴学科协调发展的学科体系。学院从政治学院在全军思想政治建设中的地位作用出发，优化专业课程结构，更新教学内容，创新教学方法手段和教学管理机制，培养适应部队需要的“政治信念坚定、理论基础扎实、任职能力过硬、军事素质较高”的新型政工人才。

截至2015年5月，学院先后建立了邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观和中国特色社会主义理论体系的教学体系；连续4次参加全军政治理论课教学观摩比赛，均获得一等奖；总结实施的“两个三进入”——党的创新理论院内“进教材、进课堂、进学员思想”、院外“进部队、进社区、进网络”的成功经验，成为学院的著名品牌。

截至2015年5月，马克思主义理论系获国家级教学成果二等奖1项，1门课程被评为国家精品课程（马克思主义哲学原理），在全军院校教学观摩比赛中连续获得一等奖，2012年荣立集体三等功。

军事新闻传播系是全军唯一的军事新闻人才培养基地，并建有多个现代化专修室，其中军队报刊网络采编专修室不仅可完成《报版自动化编排》课程教学，还可供各类学员模拟军队媒体工作流程，编排各类实习报刊；电视摄像、电视编辑专修室拥有电视节目摄制、编辑、收录设备；军事广播（新闻演播）专修室拥有专业播音间及先进的采编设备。

学院军事思想与军事历史系是全军军事思想、军事历史、中共党史及军史编研工作专门人才的培养基地，也是全军军事思想及军事历史、党的军事指导理论、中共党史、中国近现代史、军史编研工作等学科领域的专业干部和部队各级军官的培训与进修基地。截至2015年5月，该系先后获得国家级优秀教学成果二等奖2项，军队级优秀教学成果一等奖2项、三等奖1项，全军优秀网络课程二等奖1项。

学院军队政治理论教育二系是全军经济学、政治学、国际关系学和军事法学与法律战专门人才的生长基地，也是全军马克思主义理论、经济学、政治学、科学社会主义与国际共产主义运动、国际关系学、军事法学与法律战等学科专业现职教研人员和部队各级军官的培训和进修基地。截至2006年5月，该系获国家级优秀教学成果二等奖2项、军队级优秀教学成果一、二等奖各1项、全国网络和多媒体制作大赛一等奖1项。

截至2015年5月，学院拥有新闻编辑实验室、广播新闻实验室、电视新闻实验室、新闻摄影实验室、政治工作作战指挥模拟中心、军队文化工作专修室、战时政治工作专修室、心理学实验室、军事专修室、语言教学中心、计算机教学中心、文献保护技术中心等教学中心。

此外，学院在南京市郊建有占地约200亩功能完善的军事训练基地，在江苏张家港市、江苏茅山、上海浦东开发区、江西井冈山、南京军区某集团军以及部队各新闻单位建有实践教学基地和实习点，每年组织各专业学员深入社会和部队进行调查研究、当兵代职锻炼、课程实习和毕业实习等实践活动。

学院本科学员毕业后职务等级确定为副连职，授予中尉军衔，面向全军部队分配。其中，综合表现特别优秀，被评为优等生的毕业学员还将高定一级军衔并高定一个工资档次。本科毕业生在毕业前，可直接报考该院或军内其他院校、科研单位的硕士研究生，成绩优异的可推荐免试攻读该院硕士研究生。

截至2012年5月，学院设有设有心理战专业研究中心、军队政治工作信息化研发中心、军队政治工作研究所、中国特色社会主义研究所、外军政治性工作研究所、军事信息资源研究所、中共上海地下组织斗争史研究中心等科研机构。

学院在在马克思主义理论、军队政治工作学、法学、哲学、经济学、政治学、军事新闻学、军事历史学、军事心理学、军事信息管理等学科领域的研究具有较强的优势。“十二五”期间，学院先后获军队（省、部）级以上科技成果奖46项，其中国家科技进步二等奖1项，军队级科研成果特别奖2项、一等奖4项；共承担军队（省部）级以上课题190余项，其中国家级重大课题1项、重点课题4项，军队级重大课题1项，重点课题10项，军委和总部委托课题42项。

学院办有《南京政治学院学报》、《军队政工理论研究》和《军事历史研究》3个学术刊物，其中《南京政治学院学报》为全国中文核心期刊、中文社会科学引文索引来源期刊、军事学核心期刊，获第三届国家期刊奖提名奖，两次被评为“全国三十佳社科学报”，这是社科学报的最高奖项。《军队政工理论研究》是全军政治理论刊物，系全国中文核心期刊、中国人文社会科学核心期刊。《军事历史研究》系全国中文核心期刊、中国期刊方阵双效期刊。

截至2015年5月，学院图书馆藏书总量100余万册，中外文期刊2800余种，并与中国国内数百所高等院校和科研单位建立了稳定的信息交流关系，如2014年5月，南京政治学院图书馆与南京图书馆开展合作，实现军地优质图书资源共享。并且学院在全军率先建成数字图书馆，实现了与全军和全国高校图书馆联网，拥有图书馆计算机自动化管理系统、电子阅览室和先进的缩微、复制等专业设备。

忠诚使命、以身作则

严谨求实、言传身教

博采专攻、学以致用

主体思想：育忠诚于党的举旗人、做献身使命的带兵人。

“军魂”主题雕塑含义：雕塑通体赤红，主体由一把直指云天的钢枪和一面党旗组成，寓意“党指挥枪”这一解放军永远不变的军魂，为全体教职员工定下了精神坐标。环绕“军魂”雕塑蜿蜒展开的犹如双臂的学子路、名师路两条主干道，矗立着24座文化灯箱，展示着从这里走出去的优秀学员和学院中的名师大家。文化广场上，由军旅书法家李铎书写的“育忠诚于党的举旗人，做献身使命的带兵人”，彰显了“军魂文化”的精神内涵。

在学院，第二课堂活动是该院教育的延伸和深化。在一年一度的五月歌会中，艺术团、书画研究院、军乐队、锣鼓队等团体挑起文化活动大梁。此外，历史学专业学员排演的《延安的决裂》《遵义的春天》等历史话剧和新闻学专业学员发起的校园“DV大赛”为该院学员队的特色业余文化生活。并且，学院定期组织学员到一线部队开展“军魂寻根行”活动，与基层官兵一起“话使命、颂成就、学传统”。

截至2013年11月，该院学员先后组织了东南海防行、河西走廊行、革命圣地行、东北边防行、长征战场寻访和蓝色军港行，以新闻、摄影、纪录片、报告文学等形式反映所思所想，记录心得体会。