南京航空航天大学集成电路学院起源于1959年成立的无线电系，经过60余年不懈努力和发展，为国家培养电子信息领域人才1.1万余名。在集成电路领域，1996年获批电路与系统二级学科硕士学位授权点；2009年获批微电子科学与工程本科专业；2012年自主增设集成电路设计二级学科博士点；2019年获批电子信息博士专业学位授权点；2021年集成电路/电子信息工程学院合署办公，同年11月获批集成电路科学与工程一级学科硕士授权点；2022年获批“空天集成电路与微系统”工信部重点实验室。

2023年12月27日，南京航空航天大学集成电路学院揭牌独立运行，同时，南京航空航天大学集成电路学院产教融合战略委员会成立。