2008年（平成20年）12月15日：设立“女性和儿童的安心车厢”。

2009年（平成21年）1月30日：札幌市交通局发行专用智能卡“SPACIA”，可在札幌市营地下铁使用。

2012年（平成24年）3月25日：3000型列车全数退役。6月4日：ATO（自动列车驾驶装置）导入，各站停车时间延长，麻生站的折返方法变更。

2013年（平成25年）3月2日：全线可动式月台栅栏（月台门）设置完毕。4月1日：所有列车全面改为单人驾驶运行。

2014年（平成26年）度：全线完成安装月台幕门的工程。

为了节省建筑成本，南北线平岸至真驹内路段在原定山溪铁道的路线建设高架路段而成。为了防止冬季大雪影响南北线的营运和避免沿线居民受噪音骚扰，所有高架路段均安装铝合金制屏障，为世界上首次采用的设计，并成为札幌市营地铁的特征。在决定安装屏障前，札幌市交通局曾考虑开发除雪用车辆和在轨道上加装发热线以融解积雪。

但经过长年累月的使用，屏障开始老化。此外，为了避免日间融化的积雪掉下击伤在地面行驶的列车，每天深夜须以人手清理屏障顶部的积雪。另外，铝合金制屏障亦会影响附近楼宇接收电视和电台的信号。札幌市交通局遂在该地区设置电视和电台天线供该地区使用。但电视信号正逐渐改为数码地面广播信号传输，届时札幌市交通局将会更换天线，以对应数字信号。

南北线全线共有20列120节（2012年3月25日）列车服务：

南北线专属车辆基地为南车辆基地，位于自卫队前车站东南偏南方向，和南北线本线非常接近。南车辆基地为地面车辆基地，负责维护南北线全线20列5000型列车。

南北线大部分列车均为全线运转交路，只有部分回库列车以自卫队前为终点站。以前曾有从自卫队前开往麻生的出库运转交路，现在则只有从麻生开往自卫队前的回库运转交路。至于从南车辆基地驶出，前往麻生的出库列车，现在需先于自卫队前站折返前往真驹内站，到达后才正式开始服务。其他回库列车则在到达真驹内站后，经自卫队前站折返前往南车辆基地。

班次方面，早上繁忙时间每3至4分钟一班，傍晚繁忙时间每5至6分钟一班，非繁忙时间每6至7分钟一班。

札幌市营地铁的女性专用车厢称为“女性和儿童的安心车厢”，于2008年12月15日在南北线正式投入服务，是最早开设女性专用车厢的札幌市营地铁路线。车厢设于往真驹内方向的车头（1号车厢），容许“女性”、“小学六年级以下的男孩”和“残疾人士和其保母”乘坐，但非强制性。“女性和儿童的安心车厢”的实施时间在平日首班列车至早上9时，9时后所有列车同时解除限制。

由于车门数目不同，南北线两款列车中“女性和儿童的安心车厢”的登车位置也有少许分别。往麻生方向时，3000型列车需在绿色15、16号门登车，5000型列车则在蓝色21－24号门。往真驹内方向时，3000型列车需在绿色1、2号门登车，5000型列车则在蓝色1－4号门。

根据札幌市交通局的调查，2006年度每日平均有237,351人使用南北线（换乘南北线的乘客除外），比2005年度上升0.4%。如计算换乘南北线的乘客，乘客人数可达285,344人。

2007年度南北线的营业系数为62.12，是少数录得营利的日本公营地铁路线。

北24条站：札幌市电铁北线- 1974年废除

铁北线，本来是札幌火车站前面一站-新琴似车站前车站之间运行了路线，南北线北24条站-真驹内站间开业时，并行的札幌火车站前面一站-北24条站间只被废除了。南北线中，残る北24条站以北的部分并行的一部分开业于1978年，这期间北24条-麻生（新琴似）之间的铁路路线是空白。

大通站：札幌市电西4丁目线（三越前车站）- 1973年废除

旭市电车站：札幌西4丁目线- 1973年废除

以往可换乘路线

大通：札幌市电西4丁目线（三越前停留场）－1973年被废除

薄野：札幌市电西4丁目线－1973年被废除