南太平洋铁路，于1865年以地产控股公司的名义成立，是中太平洋铁路的一部份。铁路沿线总长度在多年间也曾出现重大变化，1929年的总长度为13,848英里，至1994年已缩减至8,991英里。铁路营运者为“南太平洋公司”（SouthernPacificCompany），在并购多间小型铁路公司后，至1900年已晋身为一间大型铁路公司。1959年，南太平洋铁路公司收购了中太平洋公司。

1988年8月9日，美国ICC批准营运丹佛-里奥格兰德西方铁路的母公司“里奥格兰德工业”收购南太平洋铁路，同年10月13日接管铁路。由于财政问题，南太平洋铁路于1996年由联合太平洋铁路所收购。