1975年9月，为迎接广西壮族自治区成立20周年，南宁站站房进行改建工程设计。

1978年2月16日，南宁站房扩建、新建工程开工。同年12月1日，南宁站新站房正式办理客运业务。

1983年，南宁站新站房获广西壮族自治区金质设计奖和优质工程奖。

1999年3月，经原中华人民共和国铁道部批准， 南宁站由一等站升为特等站，副处级建制。

2000年10月，南宁站主体站房装修。装修后的主体站房与软席候车室、售票大厅融为一体。

2004年，为迎接首届中国—东盟博览会（时称“南博会”）的召开，南宁站再次进行装修，主要包括两个候车室的改造，对售票大厅、天桥进行全面装修改造和整个站区环境的美化和相应的配套系统建设。

2009年1月1日，南宁站开行南宁至越南河内（嘉林）国际列车，南宁因此成为除北京外第二个有国际旅客列车始发的城市。

2010年，南宁站屋顶和部分线路局部大修。

2013年3月，南宁站开始新一轮站场改造施工。站改分为南站场和北站场，南站场首先进行站改。12月，南宁站7至13股道开通，之后进行北站场站改。12月30日，南宁站发出首列正式运营的动车组列车D8204次，标志着南宁站高铁运营就此拉开序幕。

2014年7月，南宁站5股道、6股道开通，进一步提升了车站接发车能力。同年11月7日，南宁站实名制验证闸机开始投入使用。

2015年1月，南宁站营业部开办高铁快运业务，初期涉及南宁、贵港、北海、钦州、防城、百色和崇左6个市区。同年3月20日，南宁站1至4股道正式投入使用，至此，南宁站站场改造施工基本完成，客车到发线由原来9条增至13条。

2018年1月，南宁站启用人脸识别闸机，开启“刷脸”进站模式。

2021年1月，启用“铁路e卡通”。

2022年6月22日，新建南宁至崇左铁路引入南宁站站改施工顺利完成，标志着南崇铁路与既有南宁站实现互联互通。

截至2013年9月，南宁站站房面积7000平方米。截至2001年，南宁站站前广场总面积7.15万平方米，实际使用面积3.08万平方米，地下建筑1.19万平方米，地下人防工程3883平方米。

截至2013年12月，南宁站站台长550米、宽10.5米、高1.25米，整体上看，高铁站台气势恢宏、宽敞靓丽，站台上一根根细小的柱子将雨棚顶起。柱子使用细小结构，能减少柱子占据站台的面积，以腾出更多的空间。两座旅客天桥横跨过每个站台，天桥通道宽约10米，天桥每跨过的站台都有上下站台的阶梯。此外，旅客地道在轨道地下穿行而过。

南宁站站房自1978年改扩建后，站房内增建了贵宾室、售票厅、行包房、办公楼等，站房以南增建了广场及雨棚等设施，该布局沿用至今（截至2015年11月）。

截至2010年7月，南宁站站房为地上二层结构，设有4个候车室，分列于上下两层中厅的两侧。其中第一、二候车室位于一层，第三、四候车室位于二层。

截至2018年11月，南宁站站房南侧为站前广场，站前广场设东、西两个进站口。广场前为中华路与朝阳路交汇口，中华路上方高架为南宁东西向快速路。

截至2015年3月，南宁站设有7个站台（1个侧式站台，6个岛式站台），13个站台面，13条到发线。引入线路为湘桂铁路、南昆高速铁路、南广高铁、柳南客专、南崇高铁。

截至2016年1月，南宁站设有30台自动售取票机，位于南宁站站房东侧。

自2019年1月起，旅客持中华人民共和国居民身份证、港澳台居民居住证等有效证件在12306.cn（含手机APP）上购买“D”、“G”字头车票后，不需再换取纸质车票，可持购票时所用的有效证件在南宁站直接刷证检票进出站。

截至2013年12月，南宁站高铁站台同时配设有手扶电梯和升降电梯。从天桥上下到每个站台的阶梯旁有电手扶梯，此外在阶梯的另一侧还另有一部升降电梯。

2014年，南宁站组织发送旅客1432.2万人，比上年增长43.8%。

2015年，南宁站发送旅客1131.2万人。

2019年4月4日，南宁站发送旅客8.25万人次，刷新单日旅客发送量纪录。

首府车站，永创典范

截至2015年11月，南宁站曾先后获“全国卫生车站”“全国爱国卫生先进单位”“全国青年文明号”，铁道部、自治区、南宁市“文明单位”，自治区“先进基层党组织”，铁道部“文明车站”“先进优质车站”“三星级优质货场”“全国文明单位”等荣誉称号。

南宁站与南宁东站各有分工、互为补充，其中南宁站主要办理普速客车的客运业务。（《南宁日报》 评）

南宁站是一个集客货运输业务于一体的特等车站，伴随着广西经济社会的蓬勃发展，南宁站发生了巨大变化，南宁站始发、通过的旅客列车可达全国各大城市以及广西区内各地市。南宁站是广西主要客流和重要物资集散地，担负着华南与大西南经济区域客货运输的重任。（南宁站站长杨水生 评）