南昌南站位于京九铁路、京港高速铁路、杭昌高速铁路、沪昆高速铁路、昌福铁路的交会处。其中京九铁路上行距莲塘站9千米，下行距向塘站4千米；京港高速铁路上行距莲塘站9千米，下行距丰城东站12千米。南昌南站距南昌站15千米，与南昌东站间距13.5千米，与南昌西站间距27.3千米。

南昌南站位于中国江西省南昌市南昌县城市控规区南边，车站大致呈正北至正南方向布置。南昌南站地处上海—瑞丽公路（G320）旁，距离北京—澳门公路（G105）、南昌市南外环高速公路（G6021）分别为2千米、3千米。

南昌南站站房以“江南粮仓，五谷丰登”为设计理念，整体造型取江南“粮仓”的意象，建筑屋面形成二个高低不同层次，如粮仓，似谷堆，设计提取“稻米”及南昌县代表花卉“荷花”的轮廓形态，将其进行提炼、重组，通过石材雕刻、材料组合的方式运用在公共空间室内装饰中，展现“谷穗横仓”，“荷香溢站”的丰收喜庆场景。南昌南站外立面的百叶节奏强烈，呈现横向舒展的态势，建筑细部取自当地的传统纹样，呼应“千年古县”的独特历史文化。新增入口门廊与“粮仓”元素呼应，建筑风格统一，立面层次更丰富。

截至2023年11月，南昌南站站房总面积为8000平方米，站房总长130.2米，总宽46米，建筑高度19.1米。候车厅面积为3956平方米，最高可同时容纳1500名旅客。

截至2023年11月，南昌南站站前广场面积为7.4万平方米，其中主广场占地2.2万平方米。

南昌南站为线侧平式站房，站场中心位置设置跨线人行天桥，作为旅客进、出站通道，候车厅上方采用网架结构。南昌南站主体为地上两层，地下局部一层。

南昌南站北侧为站前广场及交通场地。南昌南站站前广场中部为景观步行空间，南侧为文化公园、休闲广场。南昌南站地面广场及交通场站主要功能为旅客集散及换乘广场、公交场站、小汽车落客区、地面景观绿化、广场雨棚；地下空间主要功能为旅客集散及换乘空间、地下商业、出租车场、社会车场、附属用房、地下车行出入口通道、地下二层联通道、垂直交通设施。休闲广场主要功能为景观休闲广场，含绿化工程、硬化工程、景观工程。

截至2023年11月，南昌南站站场规模为3台8线，途经该站的线路为京九铁路、京港高速铁路、杭昌高速铁路、沪昆高速铁路及昌福铁路。

截至2023年12月，南昌南站售票厅设有4个售票窗口以及2台自动售票机为旅客提供购票服务。

截至2023年12月，南昌南站检票口设有4台自助检票闸机，乘客刷身份证验证即可完成检票乘车。

截至2023年12月，南昌南站设有一个客户服务中心，为旅客提供购票、改签、退票等服务。

截至2023年12月，南昌南站客户服务中心设有公安制证窗口，为未带身份证的旅客提供便利制证服务。

截至2023年12月，南昌南站客户服务中心设有无障碍窗口，为残障旅客的购票提供便利服务。

截至2023年11月，南昌南站站前广场设有390个停车位，方便旅客的接驳。

截至2023年12月，南昌南站设有智能空调系统，该系统会随着站内候车旅客的增加而自动启动降温功能，并将温度调节到人体适宜的温度。

截至2023年12月，南昌南站站台层设有智能灯光系统，该系统能够敏锐地捕捉到光线条件，从而在列车进站前15分钟以及列车驶出后10分钟，有一个逐渐从暗到亮再变暗的过程，最终达到节能环保。

截至2023年12月，共有4路公交线路途经南昌南站并设站。

截至2023年，南昌南站候车厅内设有小莲花服务台，为旅客提供问询、指引、改签、特殊旅客进站等服务。

截至2023年12月，南昌南站客户服务中心西侧设有青年学雷锋志愿服务台，为旅客提供志愿服务。

南昌南站规划将打造成为汇集高速铁路、城市轨道、公路客运、公交、出租等多种交通方式于一体的交通枢纽。

南昌南站规划接入南昌轨道交通3号线南延线，该线路起点为银三角北站，终点为南昌南站，线路长度2.6千米，总投资16.9亿元，该项目预计2024年开工，2029年完工。

南昌南站是京港高速铁路和京九铁路上重要的客运车站，有“南昌南大门”之称。南昌南站改建运营后，将有效提升昌赣高速铁路、京九铁路以及沪昆铁路联络线等客运运力，构成南昌市发达、现代、完备的交通网络，促进经济快速发展。（《江西日报》 评）

南昌南站处于中国国家“八纵八横”高速铁路网的“京港通道”，衔接京九铁路，杭昌、昌赣、沪昆高速铁路及昌福铁路5条干线铁路，是南昌枢纽“三主两辅”布局（南昌站、南昌西站、南昌东站为主，南昌南站、昌北机场站为辅）的客运站。（《光明日报》 评）

南昌南站的建设，将进一步提升南昌市的现代化综合交通枢纽，增强南昌市的辐射力、影响力和带动力；将大大增加南昌县在全中国的辐射影响力，吸引更多的观光者、投资者来南昌县参观旅游、投资兴业。南昌南站建成后，将成为南昌市、南昌县对外开放的新窗口，对接融入长江经济带，促进经济快速发展的重要现代化交通枢纽。（《中国日报》 评）