南昌西站地下设有南北通廊，每个站台的出站口都连接此通廊，该通廊连接西站南北两个广场。其中，北广场是集商业、商务、金融、文化、酒店、娱乐、公寓等多功能综合的城市副中心区。南昌西站核心片区整体空间形态围绕西站大街和中轴线布局高层建筑，外围空间相对较低，呈圈层化分布，形成裙房、高层建筑、超高层建筑三级空间形态，其中高层建筑呈“T”型布局；南昌西站南广场建筑面积约8.73万平方米，建有地面广场、地下商业街，地铁站厅、大型地下停车场、公交枢纽站、地面绿化亮化及其他综合配套管线工程。此外，南昌西站南广场还建有汽车换乘、出租车停车场等公用交通设施和大型地下停车场，使旅客实现长途大巴、地铁、高铁的零换乘。

南昌西站站房采用线上高架候车结构，包括南北两个站房和高架站房，并在两侧设置站前高架和落客平台。南昌西站站房共分为地下三层、地上两层。

南昌西站的地面一层（进站及购票区）为广场进站层，设南北站房、中部进站广厅和基本站台候车区，两侧为售票厅、服务区及贵宾区。

南昌西站的地上二层（商业购物及餐饮）为高架候车层，由高架道路、售票厅、中部候车区组成，并设有商业服务夹层。商业区主要设有两个西式快餐店，一个中式快餐店，一个工艺品店，一个书店和一个咖啡厅。

南昌西站的地下一层（出站及公交换乘）的站内主要是出站区和站台区，站外则是南昌西站广场、公交车停车候车区、长途汽车站区、出租车区等配套服务地带。地下一层东西两侧为出租车候车带和出租车通道，南北为社会车辆停车场及部分商业开发设施，中部为出站厅及公共换乘通道。

南昌西站的地下三层为地铁4号线站台层，地下二层为地铁2号线站台层。

截至2013年9月，南昌西站设12站台26线，其中正线4条，到发线22条，包括10个岛式站台和2个侧式站台。南昌西站的途经线路有沪昆高速铁路、昌九城际铁路和向莆铁路。

2022年1月，开办“铁路e卡通”业务。

截至2013年9月，南昌西站两个售票处均设置有自动售取票机，共计有16台，其中位于站台层北面的1号售票处设置有8台，高架层东侧的3号售票处设置有8台。

南昌西站设置了公安制证窗口，位于车站售票厅内，供遗失了身份证的旅客办理购票所需的临时身份证明。

2015年春运，南昌西站发送旅客共计114.5万人次，同比增加85.6万人次，增长296.2%，日均发送2.8万人次。

南昌西站设置有地铁南昌西站，途经线路为南昌地铁2号线。需要乘坐地铁的旅客可前往南昌西站南广场站2号出口；需要乘坐高铁的旅客可以在地铁南昌西站下车，车站就位于火车站的下方，从地下二层站台层上到地下一层的站厅层后，在站厅层东西两侧可通过自动扶梯到达地上二层火车站候车大厅。

南昌西站的公交下客站位于地上广场，公交上客站位于地下广场。旅客下了公交车，直接由地上广场进站候车；旅客出站后，就直接在出站大厅上公交车抵达目的地。

截至2021年2月，共有22条公交线路到达南昌西站，分别为：

南昌西站北侧为下沉式广场，设有公交车出租车停靠站。

南昌西站肩负着“承东启西、沟通南北”的使命，南昌西站将与南昌站一起，进一步强化南昌交通枢纽的地位，使南昌成为华中地区最重要的铁路客运枢纽。同时，南昌西站作为高铁客运站，是南昌市九龙湖片区集铁路、地铁、市政交通设施于一体的大型综合枢纽，提升了九龙湖及南昌市的功能和价值。