1996年，增设五专企业管理科及二专夜间部电机工程科、机械工程二科。

1997年，增设五专资讯管理科、二专夜间部应用外语科日文组。

1998年，增设二专夜间部资讯管理科、应用外语科英文组。

1999年，增设二专夜间部土木工程科、建筑工程科等二科。

2001年，奉准改制更名为“南荣技术学院”。增设二技日间部电子工程系、电机工程系、企业管理系等三系及二专日间部资讯管理科、应用外语（英、日文组）科等二科。增设岩石力学实验室（营建工程系）、光电科技中心（电子工程系）、能源科技中心（电机工程系）。

2002年，增设二技日间部营建工程系、国际贸易系、四技日间部电子工程系、电机工程系、机械工程系及二技进修部电机工程系、机械工程系、企业管理系。

2003年，“工业工程与管理科”更名为“管理与资讯系”。增设四技日间部营建工程系、管理与资讯系、国际贸易系、机械工程系及二技进修部应用英语系、四技进修部电子与资讯系、电机工程二系。五专部土木工程科停招。

2004年，增设二技夜间部资讯管理系、四技日夜间部企业管理系、四技日间部餐旅管理系、四技日间部室内设计系。五专部电子工程系停招。增设非破坏检测实验室（营建工程系）。

2005年，“国际贸易系”改名为“财务金融系”。增设四技夜间部营建工程系、四技日夜间部资讯管理系、四技日夜间部财金融系。二专夜间部土木工程科停招。

2006年，增设二技夜间部管理与资讯系、二技日间部资讯管理系、二专日间部餐旅管理系。二技日间部土木工程科停招。

2007年，增设工程科技研究所在职专班、四技夜间部餐旅管理系。

2008年，增设数位创意行销学位学程（四年学制）、四技夜间部管理与资讯系。

2009年，“应用英语系”更名为“观光系”。增设四技日间部观光系。

2010年，增设四技日间部营建工程系资讯应用组、绿色科技组。二专日间部电子工程科、资讯工程科停招。

第一任：刘兆瑸教授

第二任：沈乃霖博士

第三任：张荣宗先生

第四任：沈柏欣教授

第五任（代理）：陈如林 先生

第六任：沈柏昌博士

第七任：叶茂荣博士

第七任（代理）：王俊惠博士

现八任：林义宗博士

第一、二、三届：沈荣先生

第四、五届：沈水德先生

第六、七、八、九届：沈达吉先生

第十、十一、十二届：沈佩香女士

第十三届：沈义方先生

第十四届：沈柏青先生

该校包括三学群及一中心（工程科技学群、商业管理学群、人文休闲群、通识教育中心）。其中工程科技学群设立硕士学位课程。

通识教育中心于2002学年度成立，隶属于教务处为二级单位，负责全校通识教育课程之规画及执行。核心与分类通识课程包含九大领域：人文艺术、社会科学、自然科学、生命科学域、语言及应用、宗教哲学、专业通识、体育、国防通识领域等。强调德、智、体、群、美、技六育均衡发展，培养具有职业道德、文化素养与终身学习能力之科技与人文并重之人才，以达“全人教育”的终极目标。为强化通识教育发展，该校通过将通识教育中心提升胃一级单位的组织章程，纳入学校整体规划的参考。

下设工程科技研究所、电机工程系、电子工程系、营建工程系、机械工程系、资讯工程系。其教育目标与教学愿景在于整合工程科技研究所、电机工程系、电子工程系、资讯工程系、机械工程系及营建工程系等系所的师资与设备，推动跨领域教学与研究整合，并因应工业环境的快速变迁，培育工程科技的人才，并善用地缘关系，与邻近工业区结盟，积极进行产学合作、研究开发与专业基础人才培训，孕育具有实务经验与理论根基之基础专业人才。该学群与新营工业区、南部科学工业园区、台南科技工业园区、官田工业区、义竹工业区等邻近厂商需求，签订产学合作，资源共享共同开发新技术，并推动各项在职人员教育及专业技术训练，提供地区人员进修，落实终身教育，以促进地区繁荣与发展。

下设数位行销系、数位创意行销学位学程、资讯管理系、管理与资讯系、企业管理系、财务金融系。该学群的成立是在整合学群的资源，除了达到避免重复投资的目的外，更希望能达成资源共享的目的；在崭新的空间与时机下，商管学群已陆续推动课程、实习实验室以及研究与发展等的整合，以建立学群本身的特色。在学校教育理念“精、研、致、用”与学校发展重点“人本数位科技”之下，更融入校长的治学理念“人性、尊重、关怀”，建立起学群“数位创意”的特色。在实习实验室的整合方面，配合时代的趋势与学生就业的取向，鼓励与投资成立证照考照教室、数位行销教室、数位内容教室。

下设观光系、餐旅管理系、应用日语系、室内设计系。意在培育观光、生活、休闲、设计的实务与管理整合人才，成立区域观光休闲咨询服务中心。注重人文休闲，整合料理、休憩、观光导览、环境规划等特色。创造多元的知识与实务能力之专业人才，使更具竞争优势。