南部商务区站（3号线部分）位于鄞州区天童南路和泰康中路路口，沿天童南路南北向设置。南部商务区站地下一层为站厅，二层为岛式车站。车站位于地下11米，长484.6米，宽19.7米，总建筑面积22502平方米，初步设计设4个出口。

南部商务区站（8号线部分）位于泰康中路与天童南路交叉口西侧，沿泰康中路东西向设置，与既有3号线南部商务区站换乘。