猪：临床以蹄冠、蹄叉、蹄踵、鼻端发生水疱，体温升高至41~42℃，拒食，跛行，进行性消瘦为主要特征。愈大愈肥的猪跛行和消瘦愈明显，常表现卧地不起，不能站立，跪地爬行。病情严重者蹄匣脱落。

牛：体温升高，精神抑郁，脉搏加快，结膜潮红，反刍减弱或数量减少。继之口腔黏膜潮红、干燥、发热，出现全身症状，随即迅速发生口腔病变。

羊：绵羊常成群发病，多数呈一过性，症状轻微，有时不易被察觉。仔细检查时可见唇和颊部有米粒大小的水疱。山羊患病也较轻微，症状和绵羊相同，偶尔也可见到严重病例。奶山羊口蹄疫常出现典型口蹄疫症状。

口蹄疫的临床特征与猪水疱病、猪水疱性口炎、猪水疱疹极为似，故仅根据临床症状常不能作出鉴别，发现可疑病例应进行封锁、业技术人员采集病料送到国家指定的实验室进行实验确切诊断。除国家指定的口蹄疫实验室以外，其他任何单位和个人进行口蹄病毒的分离、动物试验和保存。