更新时间:2023-12-28 22:55
在分子生物学中,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)从起始密码子开始,结束于终止密码子连续的碱基序列,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列。
开放阅读框(open reading frame,ORF)是结构基因的正常核苷酸序列,从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链,其间不存在使翻译中断的终止密码子。
在mRNA序列中,每三个连续碱基(即三联“密码子”)编码相应的氨基酸。其中有一个起始密码子AUG和三个终止密码子UAA、UAG、UGA。核糖体从起始密码子开始翻译,沿着mRNA序列合成多肽链并不断延伸,遇到终止密码子时,多肽链的延伸反应终止。由于读写位置不同,ORF在下图链上具有六种可能性。
有很多找ORF的软件,包括在线的,如:ORF Finder的功能ORF Finder被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计,应用优于长片断、高质量的匹配。ORF Finder把提交序列分成六个亚区,并对这六个阅读框分别进行默认,赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量,如果可能将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照已有的分类结果,被随机提交给查找它们是否编码蛋白质的特定测试收集器。最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报道。