1683年，施琅率军于台湾澎湖击溃郑氏王朝。

1684年4月，经施琅力陈，清康熙皇帝正式设郡县于台湾，设立台湾府，隶属于福建省，并延续明郑时期承天府、天兴县、万年县设诸罗县、台湾县与凤山县三个县份。其中，台湾县县城即是台湾府城，位在台南市中西区一带，管辖范围则为今台湾台南市的南部与高雄市北边部分区域，约是北起新港溪（今盐水溪）南至二仁溪之间，面积约为2000－4500平方公里。

1734年，原凤山县罗汉门地区，即相当于今高雄市内门区以北的高雄地区改归台湾县管辖。

1835年时，调整与嘉义县的县界，改以曾文溪为界。

1887年台湾府治改迁至今台中市后，原台湾府治改为台南府治，旧台湾县改称安平县，日后安平县在日据初期原规划为台南县辖区，后改台南民政支部安平出张所，再改为台南县安平支厅。