生于“世翰林”之家。清光绪十一年(1885年)进士，选授翰林院检讨，派充贵州学政。光绪二十七年，应闽浙总督许应骙之聘，任全闽大学堂监督，在省考选贡、童生，择优入学。光绪二十九年(1903年)，又以凤池书院改名福建高等学堂。增建讲堂、宿舍，添置仪器、标本，充实设备。时新学初兴，在琦着意培育新型人才，奖掖优秀，选送京师大学堂或赴日留学；又派教员赴日本考察。光绪三十一年(1905年)，奉调进京，补御史。两年后病逝。著有《稺愔诗钞》等。