核糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶是基质蛋白中研究得最充分的一种，它含有由叶绿体基因编码的大亚基及核DNA编码的小亚基。已通过对一些组成缺陷的突变株对膜蛋白进行了研究，并分离出50多种，其中30种涉及膜的光合作用功能。它们之中有9或10种由核DNA编码(包括叶绿素a/b蛋白2、质体蓝素、铁氧还蛋白、联氧还蛋白-NADP还原酶及一些偶联因子的亚基)，有7种已知由叶绿体基因编码。