司法认定的理论根据在于：某些事实众所周知，如果要求对这些事实予以证明，未免失之迂腐。这些事实为一般人所不争议，如人的妊娠期不可能只有两个星期，某年某月某日是星期几，某地某日太阳升落的时刻等等。

此外，对某些公共文件或官方文件签署的确实性，也须依法采取司法认定。

在有些情况下，如对不属于实际常识范围之内的争议事实，法庭在决定对事实进行法律认可之前，往往会参考他认为合适的有关资料。如法庭对普通英语词汇的含义采司法认定，但为了参考起见，法庭仍旧可以查阅字典。由此而确认的事实，被视为采司法认定的结果，而非证明的结果。同样，法庭在司法上认定了外国主权，但在有疑问的时候，外务大臣的适当证明书具有决定意义。

在此情形下，司法认定与证明间的界限是很模糊的。司法认定与推定不同。