《合肥日报》共设8个版。头版为“要闻”；二版的“政声新闻”与三版的“民生新闻”对称设置，力求达到“互文见义”的效果；四版是“经济新闻”；五版为“时评”与“理论”、“县区”、“热线”的轮版，其中，理论版至少每周两次，每次半个版面，力争将马克思主义理论通俗化，以更好地武装头脑、教育干部群众，争取在理论版上办出自己的特色，在全国同类报纸中办出自己的影响。其他三个版分别是“文体新闻”、“中国新闻”和“国际新闻”。

《合肥日报》采取“导读置顶”的新模式，把当天最精彩的新闻图文并茂地展现在头版的报头之上。

《合肥日报》紧紧围绕党的中心工作，高奏推动科学发展、加速合肥崛起的主旋律，使之成为展示合肥创新实践、反映合肥发展进步、树立合肥对外形象的重要窗口。