其特点是主茎的顶芽生长到一定时期，渐渐失去生长能力，继由顶芽下部的侧芽代替顶芽生长，迅速发展为新枝，并取代了主茎的位置。不久新枝的顶芽又停止生长，再由其旁边的腋芽所代替，以此类推……这种主干是由许多腋芽发育而成的侧枝联合组成，称为合轴分枝。这种分支在幼嫩时显著呈曲折状。合轴分枝的节间较短，能多开花、结果，是丰产的分枝方式，合轴分枝植株上部或树冠呈开展状态，有效的扩大光合作用面积，是比较进化的分支方式。

有些植物，如茶树和一些树木，在幼年时为单轴分枝，成年时又出现合轴分枝。棉花植株上也有单轴分枝方式的营养枝（只长叶和芽而无花）和合轴分枝方式的果枝。