2015年11月，吉军任云南省人民检察院办公室主任。

2015年12月至2016年3月，任临沧市人民检察院检察员、检察委员会委员、副检察长。

2016年3月-2019年1月，任临沧市人民检察院检察长。

2019年1月-2020年7月，任红河哈尼族彝族自治州人民检察院代理检察长。

2020年6月，云南省高级人民法院审判员、审判委员会委员、副院长。

现任云南省高级人民法院党组成员、副院长，审判委员会委员，一级高级法官。