吉林康乃尔药业有限公司在发展的同时，注意创新和对高科技含量产品的研发。几年来，公司研制开发了国家三类新药、纯中药制剂--丹蒌片，全国独家品种、纯中药制剂--养阴通秘胶囊、杞药消渴口服液等，这些产品立足于中高端市场，与其他同类产品相比，具有吸收快，无毒副作用、有效率高、控制并发症、强化作用显著等特点，是使用人群广泛，市场前景看好的产品。

生物化学制药是近年来新兴的一门技术产业，疗效确切无毒副作用，已经成为药业发展的新趋势。公司从2004年起，向国家申报了系列个小分子多肽类药品，如：脑蛋白水解物、注射用肌氨肽苷、注射用脑苷肌肽、胸腺素注射液等，用于心脑血管治疗药及抗病毒、提高免疫力等方面。