学院是湖南省高素质软件人才培养专项改革试点单位，荣获中国软件服务外包人才培养最佳实践全国五强称号、国家民委教学成果奖一等奖、湖南省高等教育教学成果奖一等奖，全国民族院校教学成果鉴定A+ 等级。

软件工程本科专业是首批国家级一流专业建设点、湖南省一流专业建设点，是湖南省“十二五”和“十三五”综合改革试点专业，拥有国家级工程实践教育中心、国家级专业实训实习基地、“武陵创享”国家级众创空间、湖南省首批双创示范基地。软件工程专业着力打造具有人工智能背景的专业特色，为培养可持续未来竞争力的创新型卓越软件人才搭建了立交桥。湖南省教育厅专家组评价吉首大学“软件工程专业办得非常有水平、有质量”。