吴匡是兖州陈留（今河南开封市）人。

中平之初，大将军何进、车骑将军何苗皆开府。吴匡、张璋各以异端受何进信任，而何苗讨厌吴匡、张璋的为人，他们就诋毁何苗、称赞何进，何进得知后也表扬他们，认为他们与自己同心。

中平六年（189年），汉灵帝刘宏去世，刘辩继位。何进谋诛宦官，事败被杀。吴匡、张璋得知后，打算引兵入宫，而宫门关闭，便与虎贲中郎将袁术一同攻打宫门，袁术又放火烧宫门，逼迫宦官出逃。当时何苗与袁绍屯兵朱雀阙下，收斩赵忠等人。吴匡素来怨恨何苗不与何进同心，又怀疑何苗与宦官同谋，就说：“大将军打算诛杀诸常侍，车骑将军不愿。如今大将军已死，车骑还在，那么杀大将军的人就是车骑！吏士能为大将军复仇吗？”何进在世时素来对士卒有恩，因此士卒都哭着说：“愿效死。”吴匡于是唼血为誓，与张璋及奉车都尉董旻引兵攻打何苗，击破何苗于朱雀阙下，斩下了他的首级，并把他的尸体扔到苑中。