曾任广东惠州司理，从政有方，惠民清廉，严刑峻法，将数名贪赃枉法者查处究办，郡治肃然。癸酉（1633）分典乡试文武闱两元皆出其门，名声大震。制府重其才，委他剿九连山寇，希哲设奇制胜，威震东粤。复上方略建城以守，为四省保障，上闻将其擢行取会巨寇刘香，时巨寇出没海滨，制府命哲相机观变，哲应命启行入海丰界，开诚示信，寇遣人持密揭馈白镪（成串银钱）三十万两为寿，哲却不受。时贼陈兵仗凶挟道掳掠，过往船艘因惧怕，均送钱财抚人情，吴希哲使计，乔装货船覊縻之（谓宠络使不生异心），而暗修战备，约闽师会战。并策划出奇制胜，占风纵火焚击寇舰，尽歼余党，海事悉平。

丙子（1636）应江右聘分试乡闱所拔皆名士，丁丑（1637）内召敷奏详明，御笔亲擢刑科给事。条陈边防十策，切中当局之谬。已卯（1639）边围孔棘（边疆清兵侵扰），希哲奉命督浙直饷，时东南赋役繁重，疲民不堪命。希哲抚民而查处墨吏赇贿（贪官污吏赃物钱粮）以佐军需。报完复命，以年例调外，因事母，陈情终养而归。时桑梓淳邑京绢驳觧困苦，希哲上疏改折色（即本色初制品）永为定例。淳人德之，为其建起高山书院。时县令高秉衡在县城隍庙左本拟建祠以祀，希哲不许而建高山书院，云峰也建了世进士坊，县志将其入载“名臣”篇，并入乡贤祠。