吴应麒，清朝康熙年间人物，平西王吴三桂之子，过继给吴三桂兄。

吴应麒素有骁勇之名，在战场上敢冲敢拼，后任平西藩下左都统。康熙初年，平定乌撒土司作乱，吴应麒曾连擒郎岱、土酋陇安藩、水西土目阿豆、女酋陇氏及部属万余人。在此期间吴应麒与当时驻扎云南的曲靖右营总兵王辅臣在酒后发生不愉快，大将王辅臣出征云南镇雄一带的乌撒蛮族后，众将领在一马姓总兵军营中聚餐，酒酣耳热之际，辅臣忽见自己饭碗里有一只死苍蝇。那做主人的马总兵驭下酷虐，部下有过，动辄用一根木棍杖责，曾以细微的过失，棍下打死过人，得了个诨号“马一棍”。王辅臣不想伙夫因之受到责打，放下饭碗作罢。不料有个王总兵眼睛很尖，尖叫着指向王辅臣饭碗，王辅臣哈哈一笑：“我等从枪林箭雨走出来，九死一生。便是有苍蝇，我也吃得下去。”王辅臣意在一语掩过此事，但这个王总兵生性不解人意，非要打赌看他是否真的能咽苍蝇，王辅臣因话已出口，居然强撑着连蝇带饭一口下肚。一旁的吴应麒笑说：“别人与兄长赌食死苍蝇，兄长便食之；如果与兄长赌食粪便，兄长也将食粪么？”王辅臣勃然大怒，起身斥骂：“你自恃是平西王的子侄，敢当众羞辱我！人家惧怕你们吴家子子孙孙，我却不怕！且看我如何掏出你吴家子孙的脑髓，嚼其心肝，挖其眼睛！”随手一拍，桌上酒杯饭碗应声而碎。再一拳砸在酒桌上，啪嚓一声，桌子四足齐折，其神勇可畏。左右侍从的兵丁和将校多达百人，包括东道主马一棍和惹祸根芽王总兵在内，皆骇然辟易。再寻事主吴应麒，早已先众人之溜而溜。此举对王辅臣与吴三桂的感情产生了影响，王辅臣不久即请调陕西平凉。吴三桂曾大骂“王辅臣可恨自不必说了，张勇这奴才也甚可恶”，三藩之战时王辅臣拒不降吴，和吴应麒有直接关系。