1999年5月至2000年5月获聘为台当局“总统府资政”；

2001年7月获聘为中国国民党第16届中央评议委员、中央评议委员主席团主席；

2001年12月当选台湾地区第5届区域“立法委员”；

2004年12月当选为台湾地区第6届区域“立法委员”；

2007年1月10日至2009年9月9日任中国国民党秘书长；

2008年1月12日当选为台湾地区第7届区域“立法委员”。

2008年11月22日至2009年10月17日任中国国民党副主席。

2009年9月10日，担任台当局“行政院院长”。

2012年，台湾地区领导人选举中，吴敦义搭档马英九参加选举，当选副领导人。

2014年6月4日，马英九在国民党中山会报上表示将请吴敦义任党副主席。

2014年12月1日，台湾地区副领导人吴敦义正式向党主席马英九请辞副主席一职。

2014年12月3日，中国国民党主席马英九在中山会报上请辞党主席，并呼吁吴敦义留任副主席。吴敦义基于党内团结，最后同意。国民党中常会随后依据党章，通过由现任第一副主席吴敦义担任代理主席。

2015年1月17日，举行的新一任中国国民党主席选举之后，吴敦义不再担任国民党副主席。

2015年1月19日，代理主席吴敦义与新任主席朱立伦交接印信，不再代理主席一职。

2015年5月2日，被记者询问是否会在国民党内台湾地区领导人初选领表，他以“不会，阿弥陀佛”回应。

2017年1月9日，吴敦义召开参选中国国民党主席记者会，宣布参选党魁。

2017年5月20日，国民党主席候选人吴敦义得到14万4408票，以52.24%的过半得票率，当选国民党主席，任期4年。

2017年8月20日，吴敦义就任国民党主席。

2020年1月15日，中国国民党中常会正式通过吴敦义请辞党主席一职。

父亲：吴奚

妻子：蔡令怡，育有2子2女。

长子：吴子廉，儿媳：曾淳芬；

次子：吴子文；

女儿：吴子安，女婿：林泰成。

《近百年来之中美外交》

《普鲁士精神之崛起》

《自由、民主、法治之路》

《草根下的声音》等。

当选台湾当局副领导人

2012年1月，台湾选务主管机关“中选会”举行委员会议，会中审定通过并公告马英九、吴敦义当选下届台湾当局正、副领导人。该会主任委员张博雅将于20日向两人致送当选证书。

当选中国国民党主席

2017年5月20日，中共中央总书记习近平致电吴敦义,祝贺其当选中国国民党主席,希望两党以两岸同胞福祉为念,坚持“九二共识”,坚定反对“台独”,把握两岸关系和平发展正确方向,同为中华民族伟大复兴而奋斗之。

同日,新当选的中国国民党主席吴敦义复电,对习近平总书记表示感谢,期盼两党持续深化“九二共识”,推动两岸和平制度化,弘扬中华文化,促进两岸永续发展,合作走向康庄大道。

2012年4月1日，中共中央政治局常委、国务院副总理李克强在海南省博鳌会见前来出席博鳌亚洲论坛2012年年会的台湾两岸共同市场基金会代表团名誉团长吴敦义一行。

暗讽大陆免签国仅20个

2013年11月，吴敦义在台“侨务委员会议”致词表示，给予台湾免签的国家高达134个，“但我不好意思讲，有一个国家很大很大，但免签只有20个”。台下有“侨务委员”响应说“中国”，现场不少人鼓掌表示认同，吴敦义则说，“大家都知道，但我不好意思说”。

吴敦义称，台湾没恐怖分子、没造成当地困扰，也没成帮结派、非法打工问题，影响当地秩序。另外，两岸把过去冲突对撞模式，改为和平发展，而侨界的好表现，让国外观光客愿意到台湾，也有更多国家愿意给台湾免签证。

呛李登辉

吴敦义日前批评，李登辉任内黑金猖獗，遭李登辉反击，要大家想想吴敦义的外号是什么？昨（10）日下午，吴敦义出席活动时表示，过去替他取这个外号的王玉云，因为涉嫌掏空中兴银行逾70亿元后潜逃，甚至在2009年客死异乡，吴敦义希望李登辉不要学王玉云老先生学得这么快！

召集高层

吴敦义晚间将以朱立伦竞选总部荣誉主委的身份，邀请历任党内高层在圆山饭店餐叙，讨论接下来的蓝营的选战策略。名单除了朱立伦以及竞选总部主委胡志强外，还包括国民党前主席连战、吴伯雄、马英九与过去有操盘经验的历任秘书长林丰正、詹春柏、金溥聪、廖了以、曾永权与现任的李四川。其他如王金平、洪秀柱、毛治国、简太郎等党政高层都获邀出席。

接受凤凰专访

国民党主席将在5月改选，参选人之一的吴敦义接受凤凰卫视独家专访，谈及两岸议题，他表示未来若是当选，不排除前往大陆访问。吴敦义也指出，国民党主席的传统责任，就是维持两岸和平发展，防止两岸陷入对峙僵局。

国民党主席参选人吴敦义接受凤凰卫视独家专访，聚焦两岸议题，他首度公开表示，选后若当选党主席，在自然条件下，不排除访问大陆。

吴敦义特别提到，2008年国民党重新上台，同年他就应大陆方面邀请，以国民党秘书长的身份，组团前往大陆，之后出席北京奥运，主持长沙国共论坛，两年内三度访问大陆，对大陆并不陌生。

而对于2016年国民党下台，有评论认为是国民党两岸论述出了问题，吴敦义认为问题是出在洪秀柱身上。

吴敦义也批评了蔡英文当局的对外政策。

九二共识被蔡英文当局束之高阁，吴敦义感慨，若是马英九时代提出的ECFA，“两岸服务贸易协议”，“两岸货物贸易协议”能在立法院通过，台湾的经济可望有进一步发展，有些人不懂事，用意识形态捣乱两岸和平，让台湾经济陷入僵局，才应该要惩处记大过。

1998年在角逐连任高雄市长时，以4600余票之差败给民主进步党提名的谢长廷。双方竞选过程中极力抹黑对手，当时民进党籍高雄市议员陈春生掀起一场“外遇录音带风波”（而后陈春生加入国民党），吴阵营于选前数天发放白冰冰“不是人录影带”，内容指责为白晓燕命案凶嫌陈进兴辩护的谢长廷不是人，作为回击，但利用职务广发市内中小学校，对学生的负面影响即遭到联合抨击。

不是人录影带对于吴阵营形象有所伤害，而外遇录音带同样的也伤害谢阵营；但是由选举结果来看，不是人录影带对于吴阵营的伤害比较大。

至于“外遇录音带”在选举期间有台湾大学语言所副教授江文瑜声称其为真实，而后经法院调查，证实该录音带纯系伪造，陈春生因此被法院判刑六个月。

2007年1月初，时任中国国民党主席的马英九自2006年12月25日卸任台北市市长专任党主席后，表示要确切党内改革，实际上亦要求国民党原秘书长詹春柏为2006年“直辖市”市长暨市议员选举中高雄市长败选负责，撤换一级党务人员，由吴敦义出线担任国民党秘书长，亦首开党籍“立法委员”出任中央党部秘书长首例。

2009年9月7日，由于刘兆玄行政团队总辞，马英九任命吴敦义接任“行政院长”，桃园县长朱立伦为“副院长”。9月10日，台湾新“内阁”宣誓就职，吴敦义走马上任。2009年9月台湾新任所谓“行政院长”吴敦义找陈帅佛算命,在港台引起轩然大波。

“两岸如此多娇，引无数英雄竞折腰，唯反攻大陆已成历史也，解放台湾又显霸道，一国两制，或统或独，都为台海掀波涛，俱往矣，数当前明路，和平最好。”

——台湾新任“行政院长”吴敦义写词《沁园春》阐述自己的两岸见解。

2009年9月7日，台当局“总统府”发言人王郁琦召开记者会表示，马英九已任命中国国民党秘书长吴敦义为台当局“行政院长”，桃园县长朱立伦为“副院长”。

2009年9月10日，换人比率高达1/3的台湾新“内阁”，在新任“行政院长”吴敦义与“副院长”朱立伦带领下，宣誓就职。据台湾TVBS报道，上午“内阁”总辞，下午1点半“总统府”内举行宣誓就职典礼，“行政院长”、“副院长”、政务首长和“总统府”秘书长一字排开，一一唱名。

吴敦义率领新任“阁员”，高举右手，宣读誓词。马英九一一与新“阁员”握手寒暄，吴敦义与朱立伦的互动也相当良好，谈笑风生，朱立伦还跟新任“总统府”秘书长廖了以，拥抱一下，现场气氛和乐融融。下午5点，马英九与新任正、副“阁揆”举行记者会，至于卸、新任秘书长交接典礼，在下午4点，由萧万长主持。

2017年4月21日，台湾“中央社”报道，国民党主席选举监察委员会开会审查，吴敦义通过参选人资格成为正式候选人。

2017年7月26日，国民党准主席吴敦义25日起连续4天分批与国民党籍“立委”座谈，第二场邀请10位只有4位出席。