周口中院设有立案一庭、立案二庭、刑事审判第一庭、刑事审判第二庭、少年刑事审判庭、民事审判第一庭、民事审判第二庭、民事审判第三庭、知识产权庭、行政审判庭、审判监督庭、执行局（分设执行一庭、执行二庭、执行三庭）、国家赔偿办公室等13个业务部门，设有办公室、政治部、纪检监察室、机关党委、研究室、司法行政装备管理处、离退休人员工作处、法警支队、法医室、法官培训中心、绩效考核办等11个行政部门。下辖川汇区、项城市、沈丘县、太康县、淮阳县、商水县、西华县、郸城县、鹿邑县、扶沟县等10个基层法院。