中心自成立以来承担了一系列国家863重大项目、95攻关项目、973项目，先后完成了曙光1号、曙光1000至曙光6000等一系列高性能计算机系统，屡获国家级奖励，并在推广应用和产业化方面取得重要进展。

高性能计算机研究中心目前的科研工作主要集中在高性能计算机系统结构、系统软件、高性能并行算法、高性能计算应用、可重构加速计算等几个方向。中心在承担国家科研项目的同时，为国家培养了一大批优秀的计算机人才，很多人已成为企业技术骨干，或成为计算机专业的学术带头人，或走上了领导岗位。今后，中心将一如既往地以满足国家战略目标为己任，为企业提供产业共性技术，努力成为国内高端计算机产业的主要技术源头，为我国高性能计算机的发展做出新的贡献。