根据《国家林业局办公室关于印发国家林业局濒危物种进出口管理中心职能配置的通知》（办人字[2000]49号），濒管中心主要职责为：

一、

二、代表我国政府与《濒危野生动植物种国际贸易公约》（下称《公约》）所属机构及缔约国《公约》管理机构进行事务联系，会同有关部门统一制定履行《公约》的对外政策，参与研究处理与《公约》相关的重大国际事务和港澳台履约的有关事务。

三、组织研究各缔约国提交《公约》的决议、提案等文件，并提出相应的对策；会同有关部门向《公约》提出我国的决议、提案等文件草案。负责陆生野生动物和珍稀野生植物的履约工作。

四、在国家确定的年度野生动物猎捕、野生植物采集和经营利用总限额内，负责提出全国野生动植物和珍贵树木进出口限额计划，经主管部门授权，负责审批国家二级野生动物及其产品、国家一、二级野生植物及其产品的进出口，核发野生动植物或其产品的《允许进出口证明书》；统一印制和管理使用《允许进出口证明书》。