1990年9月1日，国民政府主席官邸旧址被江苏省旅游局并入金陵饭店。

2012年3月，国民政府主席官邸旧址重新划归中山陵园管理局管理。

国民政府主席官邸旧址占地面积80000平方米，建筑面积2000余平方米，由主楼、警卫室、汽车库、花园组成，主体建筑坐北朝南，高三层，另有地下室，为仿中国传统的宫殿式建筑。

国民政府主席官邸旧址依山势修造的建筑整体设计，形似一串镶有绿宝石挂坠的珍珠项链，两边通往国民政府主席官邸旧址主楼、长满了法国梧桐的环形路是“项链”，大门口是“项链”的连接处，深绿色的琉璃瓦犹如项链的宝石挂坠。

国民政府主席官邸旧址主楼是一座“凤宫”，环绕琉璃瓦屋顶的1000多个凤凰雕塑、屋檐下柱头上一排凤翎图案、二层南阳台34根汉白玉栏杆上的凤凰，都体现出女性特征。34根汉白玉栏杆和34根环楼灯柱，与宋美龄的生日3月4日暗合。

国民政府主席官邸旧址主楼建筑采用传统大屋顶，装饰以旋子彩绘，蓝底云雀琼花图案出自工笔画家陈之佛之手。国民政府主席官邸的主体为钢筋混凝土结构，耐火砖外墙，大面积落地钢窗。二层西侧有一个雕花月亮门，配上了移门做隔断，细节处均体现中西合璧的设计理念。1000多片琉璃瓦片造价较高（每一片瓦5000美金），全部是从俄国工厂定制，每一片瓦上均印有展翅腾飞的凤凰，另外别墅内外的白玉柱子及墙壁，均是进口货，且均印有凤凰，由于要求较高，这些瓦片也是修建速度慢的因素之一。

国民政府主席官邸旧址主体建筑是一座三层重檐山式宫殿，外形为明清官式做法，顶覆绿色琉璃瓦，房檐的琉璃瓦上雕有1000多只凤凰。建筑分为地下一层，地上三层。

建筑正门位于北侧，楼底层为接待室、秘书办公室等。地下一层东部分布有侍卫室、衣帽间、机要室等，东部为职员用房，西部为厨房。一层有接待室、衣帽间、秘书办公室及卧室、厨房、配膳房、洗衣室、卫生间等。

建筑二层主要作会客室与休息室之用，设有大厅、客厅、大饭厅、配膳房、书房、秘书室等。二楼大厅，是举行国宴的地方，采用长桌、西式礼节，桌面摆放欧式餐具。大厅外侧为“凸”字形平台，用花瓷砖铺地，也称“观凤台”，平台四周围以汉白玉雕凤栏杆，平台雕凤栏杆共有34根，每根立柱上各雕凤凰一只。二层北侧有个约1米高的跃层，为蒋氏夫妇专用餐厅，厅内是一张两人坐的小桌。

建筑三层为居住部分，内有女客厅、四间大卧室及小餐厅、厨房等。室内陈设考究，地上铺有紫红色地毯，墙上挂着名人字画。客厅改建为基督凯歌堂。东首房间为主卧，室内陈设为清一色的中式红木雕花家具，是蒋宋夫妇二人的卧房，由于蒋介石、宋美龄生活习惯的不同，卧室分为主卧与次卧，主卧在内，次卧在外。

国民政府主席官邸旧址主楼前的黑色美式别克牌轿车，是美国通用汽车公司早年的产品，20世纪30年代由美国总统富兰克林·罗斯福赠送给蒋介石夫人宋美龄，作为宋美龄的专车之一，车号为蓝色车牌的“军00385”。

有民间传言，国民政府主席官邸旧址是蒋介石送给宋美龄34岁的生日礼物，特地把它设计成“项链”形状。但这很可能只是一个美丽的误会。在建造国民政府主席官邸旧址以前，此处本是中山陵的一处警卫部。并且原建筑的设计图里，并没有关于模拟项链的记载。从史料记载上看，尚找不到证据支持此种说法。

实际上，陵园大道上形成“项圈”的法桐是民国十四年（1925年）至民国十八年（1929年）期间修建中山陵时种下的，后来，蒋介石看中了小红山这个小山坡才开始新建国民政府主席官邸，而围绕建筑一圈形成“吊坠”的法桐一直到民国二十三年（1934年）才被种下。

国民政府主席官邸旧址体现了中西合璧的设计理念，是民国时期南京地区单体规模最大的别墅，是现存较完整的民国别墅，具有较高的历史价值和艺术价值。

2012年12月至2013年9月30日，国民政府主席官邸旧址进行修缮。

2001年6月25日，包含国民政府主席官邸旧址在内的原国民政府旧址被中华人民共和国国务院公布为第五批全国重点文物保护单位。

国民政府主席官邸旧址位于江苏省南京市玄武区中山陵9号。

江苏省南京市内乘坐观光车6号线，在美玲宫（明孝陵博物馆）站下车前往。

江苏省南京市玄武区人民政府距离国民政府主席官邸旧址约7.6千米，驾车约39分钟。