国立科大的10个系分属4个部分：

社会科学类。法律与社会科学系的法律专业学制6年，学生毕业时获律师学衔；另外可授予法律博士学位。

人文科学类。哲学与人文科学设有文学、哲学、教育学、心理学、历史、绘画、雕塑、版画、乐器、图书馆和档案等专业。

医学类。医学类的两个系（医学系和牙科学系）分别培养医生和牙科医师，前者学制6年，后者学制为5年。

基础科学和技术科学。建筑与城市规划系的两个专业（建筑、城市规划）直接培养建筑师（学制均为6年）。化学系则以培养化学、临床生物化学和药物化学的硕士生为宗旨。数学、天文学与物理学系共开设3个专业（数学、物理学、天文学），学制均为5年，学生毕业时获相应的专业硕士学位。

在国立科大培养的众多杰出的人才中，有共和国总统、政府部长、省长、参议员、法官、律师、作家、艺术家、科学家、军事家和教授。