为进入德甲联赛而努力

1963年，西德开始举办新的足球职业联赛——德国联邦联赛（Bundesliga，即中文通称的德国足球甲级联赛）。当年的北方上级联赛前三名——汉堡体育俱乐部、不来梅沙洲和不伦瑞克和谐(Eintracht Braunschweig)进入联邦联赛，而圣保利只能进入当时的第二级联赛——德国北方地区联赛(Regionalliga Nord)。　此后是十余年的挫败。圣保利在1964年险些进入甲级，但未能取得在升级的小组赛中胜利。1966年又取得一次德北地区联赛的冠军，仍旧在升级赛中以2个净胜球之差输给埃森红白队(Rot-Weiß Essen)。此后圣保利又取得过在德北地方联赛1972和1973年的冠军和1971和1974年的亚军，但仍折戟于升级赛。　联邦联赛的成功和职业足球在西德的发展促成了1974年乙级联邦联赛(2. Bundesliga)的产生。圣保利当年进入德乙联赛，并在1977年终于拿到榜首并晋级德甲联赛。一年后旋即降回乙级。在德乙也很短命，1979年球队陷入破产边缘并被吊销职业竞技的执照，被迫降到第三级联赛——北部州级联赛(Oberliga Nord)。在1981和1983年球队取得上级联赛第一的成绩，但仍因财政状况不健康而未能升级。直到1984年，球队取得上级联赛第二，仅次于不来梅沙洲的二队。因后者不被允许升级，圣保利终重返德乙。

圣保利和宗教狂热现象

在1980年代中期，圣保利海盗旗作为俱乐部的非官方的象征。值得一提的是，圣保利是德国头一家正式禁止右翼和民族主义活动和展示的球队。在当年，受法西斯主义影响的足球流氓正在威胁欧洲的足球比赛。在1981年，俱乐部每场比赛平均只有1600名观众，而到了1990年代后期，每场比赛都能将2万张球票售空。

1980年代后期到1990年代，圣保利如过山车一样反复在甲级和乙级闲升降。其间1988-1991年和1995-1997年在甲级。球队取得的最好成绩是1988-1989赛季德甲第10名。　2010-2011赛季德甲第28轮圣保利主场对阵沙尔克04的比赛进行到第88分钟，圣保利拥趸用啤酒瓶砸到边裁颈部致使比赛被迫腰斩，一周后德国足协对圣保利俱乐部予以重罚。北京时间2011年4月8日，德国足协在其官网发布公告称，4月23日圣保利主场对阵不来梅的比赛，将禁止任何球迷入场观战，这是德国足协近40年对主场球迷滋事做出的最严厉处罚。 上周末德甲第28轮最先进行的一场比赛中，沙尔克先后由劳尔与德拉克斯勒破门，取得2比0的绝对优势。不愉快的事情出现在第88分钟，一个装满啤酒的塑料啤酒瓶从看台上飞入场地砸中边裁席夫纳颈部，当值主裁主裁艾泰金当即决定终止比赛。周中德国足协发布公告称：“按照德国足协相关法规，本场比赛判圣保利0比2告负，当场比赛两粒进球有效，圣保利俱乐部要对其球迷及其导致比赛腰斩的后果负责。”　今天，德国足协在其官网上通告对圣保利的处罚决定：“德国足协体育仲裁法庭处罚圣保利俱乐部，该俱乐部下一个德甲主场比赛圣保利VS云达不来梅，将不允许任何球迷到场观战。”德国体育仲裁员主席洛伦茨表示：“俱乐部的主场治安做得是否到位，涉及到球员、裁判官员和观众的合法权益是否能得到必要的保护。处罚只是为了让所有俱乐部引以为戒，并非唯一目的，外界不应质疑此处罚结果。”据悉，圣保利俱乐部可以在下周一之前上诉。

据圣保利官方消息，俱乐部已决定上诉，圣保利高层始终认为此次闹剧与俱乐部无关：“我们俱乐部没有一个人行为不检，俱乐部不应为球迷们冲动负直接责任。”而沙尔克方面此时倒更愿扮演好人角色，沙尔克体育经理黑尔特说：“我们赞成处罚，但仅限于数额较小的罚款，因为没有俱乐部可以百分之百确保主场球迷不闹事。”据悉，圣保利主场米勒门球场被罚将至少将造成百万欧元损失，甚至于俱乐部要对购买季票的死忠予以适当补偿。　之后，圣保利的上诉成功，与云达不莱梅的比赛被允许球迷进场，改为下赛季第一场主场比赛在客场进行。

新千年以来

圣保利至今的最后一次甲级之旅在2001-2002赛季。2002年2月6日，处于榜尾的圣保利队在米勒门体育场令人吃惊地2:1战胜了拜仁慕尼黑。当时已几乎确定降级的圣保利人在T恤上印上“世界俱乐部杯冠军战胜者”(Weltpokalsiegerbesieger)，因拜仁在此赛季赢得了世界俱乐部杯。本场比赛中圣保利的射手是Nico Patschinski和Thomas Meggle。直到第87分钟才由威利·萨尼奥尔扳回一球。 2001-2002赛季的降级险些使俱乐部破产，不得不接受捐款，即“拯救行动”(Retteraktion)。他们印制的带有俱乐部标志和“Retter”（“拯救”）字样的文化衫在6周内销售掉14万件。他们还组织过一场对拜仁慕尼黑(FC Bayern München)的友谊赛以缓解经济危机。

俱乐部也活跃于慈善活动中。2005年，俱乐部及其球迷发起“viva con agua de sankt pauli”行动，为古巴学校的饮水设备募捐。　在2005-2006赛季，身处北方地区联赛（丙级）的圣保利在德国杯比赛中取得了难以置信的胜利。在淘汰赛中，他们一路过关斩将，战胜了布格豪森(Wacker Burghausen)、波鸿(VfL Bochum)、柏林赫塔(Hertha Berlin)等职业球队，2006年1月25日的四分之一决赛中竟然雪地里3:1战胜了当年的德甲联赛亚军云达不莱梅(Werder Bremen)。进入德国杯半决赛为俱乐部带来大约100万欧元的电视和赞助收入，极大程度缓解了俱乐部当时危急的财政。最终，在半决赛中，圣保利在4月12日举行的半决赛中主场0:3输给了拜仁慕尼黑(Bayern München)，没能继续这一奇迹。　圣保利队在最近31年来曾经14次变换联赛，2011-2012赛季球队将征战德乙联赛。

俱乐部重要成绩和事件

1947: 汉堡州冠军　1948: 德国北部亚军，英国占领区亚军，进入德国杯决赛圈（半决赛）　1949: 德国北部亚军，进入德国杯决赛圈（四分之一决赛）　1950: 德国北部亚军，进入德国杯决赛圈（四分之一决赛）　1951: 德国北部亚军，进入德国杯决赛圈（小组赛）　1952: 在德国电视直播的首场比赛，即德国杯中3:4输给Hamborn 07　1954: 德国北部亚军　1964: 德国北方地区联赛（乙级）第1名　1966: 德国北方地区联赛（乙级）第1名　1972: 德国北方地区联赛（乙级）第1名　1973: 德国北方地区联赛（乙级）第1名　1977: 德国乙级联邦联赛第1名并升入甲级　1981：德国北方上级联赛（丙级）第1名，决赛中0:2输给科隆后获得德国业余球队亚军　1983: 德国北方上级联赛（丙级）第1名　1984: 德国北方上级联赛（丙级）第2名，升入乙级联邦联赛　1988: 德国乙级联邦联赛第2名，第2次升入甲级　1995: 德国乙级联邦联赛第2名，第3次升入甲级　1995: 在德甲首轮中4:2战胜慕尼黑1860，暂居德甲榜首　2001: 德国乙级联邦联赛第3名，第4次升入甲级　2002: 位居德甲榜尾的圣保利主场2:1战胜拜仁慕尼黑，被冠以“世界俱乐部杯冠军战胜者“(Weltpokalsiegerbesieger)称号　2006: 以丙级队的身份在德国杯中4:3和3:1分别战胜柏林赫塔和云达不莱梅杀进德国杯四强，不过在半决赛中0:3输给拜仁慕尼黑

2011：在德甲联赛中凭借阿萨莫阿的进球客场击败德比对手汉堡（1:0），结束33年逢汉堡不胜的历史，并在当赛季联赛面对汉堡1胜1平占优（主场1:1）

2024年：德乙第33轮，圣保利主场3-1击败奥斯纳布吕克，提前一轮升入德甲；这是圣保利时隔13个赛季重返德甲联赛。6月27日，圣保利宣布布勒辛成为俱乐部新任主帅。7月，圣保利签下芬·史蒂文斯。，租借吉拉沃吉。10月，德国杯第2轮，圣保利2-4不敌莱比锡，无缘晋级。

俱乐部的认同度

根据欧洲足联的一项调查显示，在德国有1100万圣保利队的追随者。这体现为球队主场和客场球票的热销：在2003-2004赛季，圣保利作为丙级球队，每场平均有1,7374名观众观看，高于所有德乙球队，而所售出的季票甚至多于一些德甲球队。