1969年，人类获得了名为科学的伟大之力。一方面，为了破坏而进行军备扩充，另一方面，为了生产而迈进经济发展，人类处于矛盾之中。就像抓住了其矛盾般，未知的敌人“侵略者”出现了。为了对抗侵略者，人类在背地秘密组成了地球防卫机构AEGIS。在联合国的指挥下，他们作为地球防卫的最后防线，集结了一群拥有特殊能力的战士“捍卫者”。

一天，极其平凡的高中生浮矢瞬，其沉睡中的捍卫者能力被AEGIS发现了。然后，她被任命为特殊游击队队长。在少年的能力苏醒之时，新的战斗故事开始了。