夏洛特·玛格丽特·德·蒙莫朗西是亨利一世·德·蒙莫朗西和其第二任妻子路易丝·德·比多的女儿。夏洛特·玛格丽特五岁丧母，由异母姊昂古莱姆公爵夫人夏洛特·德·蒙莫朗西抚养长大。为了能得到夏洛特·玛格丽特，法王亨利四世于1609年安排她与孔代亲王亨利二世·德·波旁结婚。如此一来，国王就能更加方便地在需要时与夏洛特·玛格丽特上床。为了摆脱困境，这对夫妇逃到布鲁塞尔。亨利四世对此愤怒异常，他威胁哈布斯堡总督，若后者不立刻将孔代亲王夫妇送回，他就率军进攻佛兰德斯。当时，亨利四世还扬言要就于利希-克莱沃-贝格联合公国的继承问题与哈布斯堡家族开战。所以，历史学家们也无法衡量，作为交战的借口，夏洛特·玛格丽特本人的归国到底有多重要。但孔代亲王依旧继续在佛兰德斯激怒亨利四世。当有人邀请他为法国王后干杯时，亲王回复道，法国似乎不止一位王后，可能多达四五位。夏洛特·玛格丽特的丈夫和其他大多数法国贵族一样对孔奇诺·孔奇尼的统治持强烈反对态度，后者放弃了已故国王亨利四世的政策。1616年9月，夏洛特·玛格丽特和孔代亲王被捕，双双被囚禁在万塞讷城堡内。三年后的1619年，他们的女儿安妮·热纳维耶芙·德·波旁在这里受孕并出生。1632年，夏洛特·玛格丽特唯一的兄弟蒙莫朗西公爵亨利二世·德·蒙莫朗西因与红衣主教黎塞留勾结而被处死。蒙莫朗西家族的头衔因此传给了她。她被安葬在巴黎郊区的圣雅克修道院内