多孢子，一般四分孢子体产生四分孢子囊，有产生二分孢子囊或含有四的倍数的多个孢子的多孢子囊（poly-sporangium），也有同一个体产生四分孢子囊和多孢子囊，如丛孢藻（Spermothamnion synedrae）。关于这方面的细胞学知识还几乎近于空白。据称美丽羽枝藻（Plumaria elegans）只形成三倍体，而且孢子本身也是三倍体。