这些重复DNA序列有的继续发生进化歧异，成为与原来序列不同的新基因；有的以结构和功能仍基本相同的形式保留下来成为多拷贝基因。如为rRNA和tRNA编码的基因就是典型的多拷贝基因。人的一个细胞中约有200个rDNA拷贝。还有组蛋白基因，免疫球蛋白基因等都是多拷贝基因。重复频率在10^5次以上（也有人认为是数千次或百万次以上）的称为高度重复序列。

有的DNA序列，在基因组中并不是只有一份，还有很多它的复制品，又称拷贝，它们的序列完全一样，多存在几份是为了转录RNA的时候速度快些，因为有些基因表达量大，需要快速的产生很多RNA,就叫“多拷贝基因”。

组蛋白基因、免疫球蛋白基因、tRNA基因、rRNA基因属于多拷贝基因。

人类DUF1220的拷贝有212个，而猩猩有37个，猴子只有30个。小鼠和大鼠都为单拷贝。研究者在很多地方发现这种蛋白，包括脑部神经元。这说明了某些基因的多拷贝现象与生物进化的关系。