大叶草科的学名Gunneraceae由模式属大叶草属学名Gunnera的复合形式Gunner-加上表示科的等级后缀-aceae构成。该词为复数形式，故在做主语时应与动词的复数形式搭配。

本科中文名亦由模式属中文名“大叶草属”中的专名“大叶草”加上“科”字构成。其单纯的中文别名有南洋小二仙科、洋二仙草科，详见大叶草属条目的“词源”一节。